Qu'est-ce qu'un métabolome?
Un métabolome est une décomposition détaillée de produits chimiques de signalisation, de métabolites, d'hormones et de structures similaires trouvées dans un organisme. Certains d’entre eux sont produits naturellement, d’autres par le métabolisme de divers aliments et médicaments ingérés. Au cours de son existence, la collection de composés chimiques d’un organisme changera. Il est possible de prendre un instantané dans le temps pour voir ce qu’un organisme a contenu et produit à un moment donné, mais cela changera d’un moment à l’autre.
L'étude du métabolome humain est un sujet d'intérêt particulier. Les tests médicaux reposent souvent sur des métabolites à des fins de diagnostic. Un médecin peut vérifier la présence ou l'absence de composés permettant de contrôler l'apparition ou non de maladies ou de déterminer le degré de réponse d'un patient aux médicaments. Seule une fraction est identifiable aux tests médicaux de base. Augmenter le nombre de métabolites que les médecins pourraient tester créerait plus d'opportunités pour un diagnostic et des tests précis des patients.
Cela offre une occasion unique d’étudier les interactions entre la génétique et l’environnement. Le génome code pour la production d'un certain nombre de composés tels que des hormones, des enzymes, etc. Les erreurs peuvent créer des problèmes tels que des carences ou des produits chimiques défectueux. Pendant ce temps, l'environnement a également un impact sur le métabolome d'une personne; ce que la personne mange, boit et est autrement exposé au changement de son métabolome et à la création d'un ensemble différent de produits chimiques distinctifs.
Les chercheurs qui s'intéressent à la manière dont l'environnement et la génétique peuvent interagir peuvent étudier le métabolome afin d'examiner l'intersection de ces sujets. Ils peuvent, par exemple, étudier l'influence des facteurs environnementaux sur le silence des gènes ou les activer. Cela peut également fournir des indices sur la manière dont les organismes gèrent les changements de conditions environnementales et sur ce qui se produit lorsque les organismes sont exposés aux toxines. Le métabolome contient une variété de produits chimiques que le corps utilise pour la vie, des molécules d’énergie aux cellules d’alimentation, en passant par les hormones de signalisation qui déclenchent la fertilité et permettent la reproduction.
Une équipe de recherche canadienne a été la première à développer une séquence approximative du métabolome humain. Ce travail est difficile, car des échantillons de différentes zones du corps contiennent différents produits chimiques, qui peuvent également évoluer avec le temps. Le simple séquençage des composés présents dans les cellules hépatiques, par exemple, donnerait une image différente de celle consistant à étudier les tissus et les fluides provenant d'autres parties du corps, car de nombreuses parties du métabolome sont très spécifiques à l'emplacement. Certaines cellules de signalisation ne se trouvent que dans des régions spécifiques, tandis que des métabolites spécifiques peuvent se trouver dans certaines zones du corps, mais pas dans d'autres. Un séquençage réussi nécessite un échantillonnage détaillé et méticuleux.