¿Qué es la secuenciación de ADN?
La secuenciación de ADN es una colección de métodos científicos para determinar la secuencia de las bases de nucleótidos en una molécula de ADN. Todos los organismos vivos tienen ADN (ácido desoxirribonucleico) en cada una de sus células. Cada célula de un organismo contiene el código genético de todo el organismo. El proceso de secuenciación de ADN transforma el ADN de un organismo dado en un formato que puede ser utilizado por los investigadores para el estudio básico de procesos biológicos, investigación médica y medicina forense.
Existen varios métodos que pueden usarse en la secuenciación del ADN. Los primeros métodos se desarrollaron en la década de 1970 y son muy laboriosos y requieren mucho tiempo. La reacción de secuenciación más popular y común que se usa hoy en día es la secuenciación de didesoxinucleótidos, que se puede realizar a mano o con máquinas, dependiendo de la cantidad de material a secuenciar.
La cantidad de material genético en un organismo varía considerablemente y se mide por la cantidad de bases de nucleótidos que contiene. Por ejemplo, un virus o bacteria puede tener tan solo cinco mil bases, mientras que el genoma humano contiene alrededor de tres mil millones de bases. El método de secuenciación de didesoxinucleótidos de secuenciación de ADN puede secuenciar muchos genomas en días y genomas grandes en años, en lugar de décadas.
Hay cuatro etapas en la secuenciación del ADN. Primero se debe eliminar el ADN de la célula. Luego se somete a una reacción de secuenciación. Luego, el ADN se separa por tamaño, y finalmente es analizado por una computadora que pone los resultados en un formato utilizable.
El primer paso en la secuenciación del ADN es sacar el ADN de la célula. Esto se puede hacer de forma mecánica o química. El ADN viene en dos cadenas, pero solo se puede secuenciar una cadena a la vez.
Una vez que el ADN se divide, se coloca en vectores, que son células que se auto-replicarán indefinidamente, junto con un cebador, que es un químico que inicia el proceso. Esto crea clones del ADN del organismo que se está secuenciando. La reacción de secuenciación utiliza el cebador para iniciar el proceso químico de reproducción de la segunda cadena de ADN. La secuenciación se realiza en un termociclador para que la reacción se repita muchas veces. La repetición de la reacción da como resultado un mayor rendimiento de ADN secuenciado.
Después de la secuenciación, el ADN se clasifica por tamaño por electroforesis capilar. El ADN es extraído por una corriente eléctrica a través de un gel en el capilar, que es un tubo de vidrio muy delgado. Las cadenas de ADN emergen ordenadas por longitud. A medida que emergen del capilar, pasan a través de un láser que activa los tintes que identifican las bases de nucleótidos. Esta información se alimenta a una computadora, que luego muestra la secuencia de ADN en la pantalla.