ペプチド結合とは?
ペプチド結合は、ペプチド鎖としても知られる、アミノ酸中のポリペプチドとタンパク質分子間のアミド結合です。 共有結合はペプチド結合の特徴であり、通常のペプチド合成に不可欠です。 言い換えれば、ペプチド結合は特定の順序でアミノ酸を結び付け、タンパク質ポリマーを作成し、ユニークな三次元(3D構造の形成を指示します。ペプチド結合がなければ、アミノ酸が関与する重要な反応が抑制されます。
分子化学の観点では、2つ以上のアミノ酸の結合によりペプチド分子が形成されます。 ペプチド結合は、カルボン酸分子が次のアミノ酸分子のアミノ基と反応する場所で形成されます。 結果として生じる分子は、ジペプチド(ペプチド結合によって互いにリンクされた2つのアミノ酸)です。 ペプチド結合は、結合するアミノ基に固有です。
ペプチド合成またはタンパク質合成のプロセスには、ペプチド鎖の形成と、さまざまなタイプのリボ核酸(RNA)分子(メッセンジャー、リボソーム、トランスファーRNA)およびアミノ酸との一連の生化学反応が含まれます。 タンパク質合成は、リボソームがメッセンジャーRNA(mRNA)を翻訳するときに行われ、翻訳後に2つのアミノ酸分子の間にペプチド結合が形成されます。 ペプチドが結合するたびに、ポリペプチド鎖と呼ばれるものに新しいアミノ酸が追加されます。 状況によっては、複数のリボソームがmRNAの同じ鎖を翻訳することがあります。これにより、ペプチド結合が複製され、ペプチド鎖が複製されます。
タンパク質合成が完了すると、酵素触媒反応によってポリペプチド鎖が放出され、生物学的に活性なタンパク質になる3D構造を形成します。 細菌感染症の治療に使用されるいくつかの抗生物質の有効性は、タンパク質合成中のペプチド結合に基づいています。 細菌が必要とするタンパク質の形成を妨げることにより、抗生物質は細菌の増殖を止めることができます。
ペプチド結合を阻害する抗生物質は、タンパク質合成も阻害します。 多くの抗生物質は不健康な細胞を特異的に標的とすることができないため、プロセス中に健康な細胞に影響を及ぼしますが、細菌のリボソームを標的とすることで細菌細胞のみに作用する薬剤もあります。 抗生物質の作用機序は、ペプチド結合形成を阻害することにより、RNAの転写またはペプチド鎖の成長を妨げる可能性があります。 他のメカニズムには、不完全なタンパク質コーディングと転写RNA(tRNA)の防止が含まれます。これらはすべて、生化学的媒介ペプチド結合に依存しています。
新しい抗生物質の開発を担当する研究開発チームからの需要の結果、ペプチド合成会社の必要性が浮上しました。 需要のあるペプチドサービスには、質量分析によるカスタムシーケンス、またはペプチドカタログまたはペプチドライブラリの開発が含まれます。 これらのサービスプロバイダーの一部は、修飾ペプチドと合成材料も提供しています。