Qu'est-ce que la liaison peptidique?
La liaison peptidique est une liaison amide entre des molécules de polypeptides et de protéines dans des acides aminés, également appelée chaîne peptidique. Une liaison covalente est caractéristique de la liaison peptidique et est essentielle à la synthèse peptidique normale. En d'autres termes, les liaisons peptidiques lient les acides aminés dans un ordre spécifique qui crée des polymères protéiques et dirige la formation de structures tridimensionnelles uniques (structures 3D). Sans liaison au peptide, les réactions importantes impliquant des acides aminés sont inhibées.
En termes de chimie moléculaire, la liaison de deux acides aminés ou plus forme une molécule peptidique. La liaison peptidique se forme lorsqu'une molécule d'acide carboxylique réagit avec un groupe amino dans la molécule d'acide aminé suivante. La molécule résultante est un dipeptide - deux acides aminés liés ensemble par liaison peptidique. Les liaisons peptidiques sont uniques au groupe amino auquel elles sont liées.
Le processus de synthèse peptidique, ou synthèse protéique, implique la formation d'une chaîne peptidique et d'une série de réactions biochimiques avec divers types de molécules d'acide ribonucléique (ARN) - ARN messager, ribosomal et de transfert - et acides aminés. La synthèse des protéines a lieu lorsque le ribosome traduit l'ARN messager (ARNm), et une liaison peptidique se forme entre deux molécules d'acide aminé après la traduction. Chaque fois qu'une liaison peptidique se produit, un nouvel acide aminé est ajouté à ce que l'on appelle une chaîne polypeptidique. Dans certaines circonstances, plusieurs ribosomes peuvent traduire le même brin d'ARNm, ce qui entraîne une liaison peptidique en double et donc des chaînes peptidiques en double.
Lorsque la synthèse des protéines est terminée, la chaîne polypeptidique est libérée par une réaction catalysée par une enzyme et forme une structure 3D qui devient une protéine biologiquement active. L'efficacité de certains antibiotiques utilisés pour traiter les infections bactériennes est basée sur la liaison des peptides au cours de la synthèse des protéines. En interférant avec la formation des protéines nécessaires aux bactéries, les antibiotiques peuvent empêcher les bactéries de se multiplier.
Les antibiotiques qui inhibent la liaison peptidique inhibent également la synthèse des protéines. De nombreux antibiotiques ne peuvent pas cibler spécifiquement les cellules en mauvaise santé, ils finissent donc par affecter les cellules en bonne santé au cours du processus, bien que certains médicaments agissent uniquement sur les cellules bactériennes en ciblant les ribosomes. Le mécanisme d'action des antibiotiques peut empêcher la transcription de l'ARN ou la croissance des chaînes peptidiques en inhibant la formation de liaisons peptidiques. D'autres mécanismes incluent le codage incomplet des protéines et la prévention de l'ARN de transcription (ARNt), qui reposent tous sur la liaison d'un peptide à médiation biochimique.
Un besoin de sociétés de synthèse peptidique est apparu à la suite de la demande d'équipes de recherche et développement chargées du développement de nouveaux antibiotiques. Les services de peptides à la demande comprennent le séquençage personnalisé avec spectrométrie de masse, ou le développement d'un catalogue de peptides ou d'une bibliothèque de peptides. Certains de ces fournisseurs de services fournissent également des peptides modifiés et des matériaux de synthèse.