Na genética, qual é o método da espingarda?

O método da espingarda é usado para sequenciar fios longos de uma molécula de ácido desoxirribonucleico (DNA). Ele se baseia em outro método de sequenciamento de DNA chamado método de terminação em cadeia. Com o método da espingarda, os cientistas sequenciam partes da fita de DNA e usam os resultados para criar uma sequência contínua.

O sequenciamento é o processo de encontrar a composição atômica de uma molécula e investigar as ligações químicas que unem esses átomos. No DNA, o sequenciamento é usado para encontrar a ordem em que certas moléculas ocorrem. Essas moléculas são chamadas nucleotídeos. As quatro bases nucleotídicas são adenina, guanina, citosina e timina.

Uma maneira de sequenciar fios longos de DNA é usando o método da espingarda. Neste método, o DNA é dividido em fragmentos aleatórios. Os segmentos resultantes são então sequenciados usando um método chamado método de terminação da cadeia. A terminação da cadeia é o método de escolha para sequências de DNA curtas. Usa poucos produtos químicos adversos e quantidades menores de radioatividade do queOutros métodos de sequência curta.

No método de terminação da cadeia, um fio de DNA é dividido em quatro reações de sequenciamento. Cada um contém todos os quatro nucleotídeos e uma enzima que atua como um catalisador, chamado de polimerase de DNA. Um dideoxinucleotídeo, que é basicamente um nucleotídeo que falta parte de sua sequência de açúcar, é então adicionado a cada reação de sequenciamento. Após o processamento dessas reações, os cientistas são capazes de imaginá -los e ler a sequência de DNA.

Durante o método da espingarda de DNA de sequenciamento, tudo isso acontece várias vezes usando diferentes fragmentos aleatórios de DNA. Isso resulta em várias seções sobrepostas do DNA sequenciado. Um programa de computador usa as seções sobrepostas para criar uma sequência de DNA contínua.

O problema com o método da espingarda é que o DNA é incrivelmente complexo. Freqüentemente, ele contém sequências repetitivas que parecem iguais, mas vêm de diferentes partes de tele DNA. O conjunto completo de DNA humano, chamado genoma humano, tem mais de três bilhões de pares de bases. A única maneira de ter certeza de que a colocação de sequências repetitivas está correta é fazer mais leituras aleatórias para que cada parte seja sequenciada várias vezes. Mesmo assim, os erros ocorrem.

O método de sequenciamento da espingarda foi a vanguarda do seqüenciamento de DNA até cerca de 2005. Desde então, os cientistas criaram o sequenciamento de próxima geração, que funciona muito mais rápido. A precisão das leituras individuais é menor do que com o seqüenciamento de espingarda, mas os cientistas são compensados ​​por isso, sendo capaz de fazer mais leituras em menos tempo.