Co je to zinkový prst?

Zinkový prst je proteinový záhyb ve tvaru prstu, který je tvořen specifickými aminokyselinami ve vazbě proteinu na ion zinku. Tyto proteiny se často vážou na DNA a RNA, protože jejich tvar umožňuje blízkou interakci domény s nukleotidy DNA a RNA. Jejich vlastnosti vazebných nukleotidů jim umožňují fungovat při regulaci genové exprese a sestavení viru.

Existuje několik typů struktur zinkových prstů, ale nejběžnější verze se skládá z alfa helixu a beta listu, dvou nejběžnějších sekundárních struktur v proteinech, na obou stranách alespoň jednoho zinku. Alpha helix a beta list jsou drženy v poloze cystinovými a histidinovými zbytky, koordinují zinkový ion prostřednictvím jejich atomů dusíku a síry. Zinkový prst se váže na DNA a prostřednictvím interakce aminokyselin na periferii s páry bází ve středu dvojité šroubovice DNA. Je to kompaktní proteinová doména a její malá velikost jí umožňuje mít těsnou blízkost s DNA BASE PAirs.

Tyto proteiny jsou nejčastějšími transkripčními faktory v živých organismech. Transkripční faktor je protein, který se váže na DNA a řídí přenos genetických informací na RNA. Skutečnost, že tyto proteiny k cílové DNA z nich učinily kandidáty pro účelné re-inženýrství za účelem cílení na sekvence DNA.

Například nukleáza zinkového prstu (ZFN) je syntetický protein, který má inženýrskou doménu vazebné zinkové prsty fúzované s restrikční endonukleázou nebo enzymem pro úpravu DNA. ZFN lze použít ke snížení DNA na specifických místech a je užitečným nástrojem pro podporu rekombinace DNA specifické pro místo. Jako umělé transkripční faktory lze také použít zinkové prsty zinku.

domény zinkových prstů se nacházejí v některých virových proteinech, včetně proteinu neoCAPSID (NC) viru lidské imunodeficience-1 (HIV-1). NC je atraktivní antivirový tArget, protože je důležitý pro sestavení viru a je vysoce konzervovaný. Inhibitory, které se konkrétně zaměřují na zinkové prsty virových a retrovirových proteinů, lze použít k zabránění replikaci viru. Získání antivirových sloučenin této povahy je aktivní oblastí biomedicínského výzkumu.

Tyto proteiny hrají důležitou roli v normálním metabolismu buněk. Aby byli anti-retravirové sloučeniny účinné, musí se konkrétně zaměřit na proteiny retrovirových zinků. Tyto retrovirové proteiny mají odlišné aminokyselinové sekvence a strukturální rozdíly od proteinů buněčných zinkových prstů, takže získání selektivních inhibitorů je dosažitelným cílem.

JINÉ JAZYKY

Pomohl vám tento článek? Děkuji za zpětnou vazbu Děkuji za zpětnou vazbu

Jak můžeme pomoci? Jak můžeme pomoci?