Co jsou restrikční enzymy?

Restrikční enzymy jsou enzymy, které rozpoznávají konkrétní sekvence DNA a štěpí je, oddělují řetězec DNA ve dvou, kdekoli najdou sekvence, které byly kódovány k rozpoznání. Existuje celá řada aplikací restrikčních enzymů, snad zejména v technologii rekombinantní DNA, která vědcům umožňuje manipulovat s genetickými informacemi. Rekombinantní DNA se používá pro všechno od vývoje terapeutických produktů, jako je inzulín, pro lékařské ošetření až po úpravu plodin.

Tyto enzymy jsou izolovány z bakterií. U bakterií chrání organismus před cizí DNA tím, že jej rozřezávají, když je organismus bakterie rozpoznán. Bakterie používají techniku ​​zvanou restrikční modifikace, aby se chránily před svými restrikčními enzymy, čímž zajistí, že se enzymy nezapnou na DNA samotné bakterie. Jako mechanismus sebeobrany jsou restrikční enzymy vynikající a brání replikaci cizí DNA v těle fragmentací.

Bylo objeveno mnoho restrikčních enzymů a stále více se objevuje v procesu známém jako mapování restrikčních enzymů. Několik laboratoří produkuje restrikční enzymy, které prodávají vědcům a jiným laboratořím. Každý restrikční enzym byl kódován tak, aby odpovídal na konkrétní sekvenci nukleotidů, a sekvence je obvykle palindrom, který se čte stejným směrem dozadu a dopředu. Když restrikční enzym najde sekvenci, kterou rozpoznává, prořízne obě řetězce struktury dvojité šroubovice DNA a oddělí ji. Vytvoří také více fragmentů, pokud identifikuje více než jednu kopii sekvence, kterou zná.

Některé restrikční enzymy se protínají přímo přes dvojitou šroubovici a vytvářejí takzvané tupé konce. Jiní se stříhají v různých bodech na jiných stranách a vytvářejí zubatý řez označovaný jako „lepkavé konce“. V obou případech lze enzym známý jako DNA ligáza použít k připojení části DNA k oddělené DNA, pokud jsou tyto dvě části mají komplementární konce. Tuto techniku ​​lze použít k vložení nové DNA do genomu ak manipulaci s genomem, jako by se spojily kousky dvou různých hádanek.

V některých případech je restrikční enzym kódován pro tzv. Jednoznačné rozpoznávání, což znamená, že rozpoznává pouze velmi specifické sekvence. Jiní jsou kódováni pro nejednoznačné rozpoznávání a hledají sekvence, ve kterých specifické nukleotidy zařadí jakékoli nukleotidy. Pomocí známých restrikčních enzymů mohou vědci selektivně odříznout vzorek DNA na fragmenty známé jako restrikční fragmenty.