Co je to endopeptidáza?

endopeptidáza je typ proteázy, enzym z velké skupiny, která degraduje proteiny. Enzymy jsou proteiny, které způsobují, že reakce probíhají mnohem rychleji. Proteiny se skládají z řetězců aminokyselin spojených peptidovými vazbami. Toto spojení spojuje karboxylový konec jedné aminokyseliny s amino -koncem další. Endopeptidázy štěpí peptidové vazby aminokyselin uvnitř proteinu, na rozdíl od exopeptidáz , které se štěpí na koncích proteinu.

endopeptidázy se nacházejí ve všech třídách organismů a mají širokou škálu biologických aktivit. Jsou zapojeni do trávení bílkovin v potravinách. To zahrnuje enzymy pepsin, trypsin a chymotrypsin. Proteázy jsou také zapojeny do buněčné signalizace tím, že rozkládají další proteiny, jako jsou protilátky nebo hormony. Mohou zapnout nebo vypnout dráhy.

Proteázy jsou obvykle nejprve vyrobeny jako větší molekula, která je neaktivní. To chrání buňku, která ji syntetizuje před damaged. Jakmile je proteáza doručena do svého cíle, například žaludku, je odstraněn kus molekuly. To aktivuje proteázu.

Vzhledem k jejich nesčetným rolím v buněčné funkci existuje mnoho lékařského zájmu o aktivitu endopeptidázy. Jedním z příkladů je prolyl endopeptidáza, která se štěpí konkrétně po aminokyselinovém prolinu. Byl spojen s psychologickými poruchami, jako je deprese, mánie a schizofrenie. Existuje klinický zájem o inhibitory prolyl endopeptidázy, jak je to možné antidepresiva.

Dalším příkladem je neutrální endopeptidáza, která má několik dalších jmen. Je také známý jako Neprilysin a běžný akutní lymfoblastický leukemický antigen (CALLA). Tato proteáza degraduje malé sekretované peptidy, včetně peptidu, který byl implikován jako příčina Alzheimerovy choroby a několika důležitých signalizačních peptidů. Neutrální eNdopeptidáza se někdy používá jako marker rakoviny, ale jeho role v rakovině je nejasná. Byly vyvinuty inhibitory, které pomáhají při úlevě od bolesti a kontrole vysokého krevního tlaku.

Endopeptidázy jsou umístěny v různých rodinách, v závislosti na struktuře jejich aktivního místa a podmínkách, které preferují. Existují serinové proteázy, které mají na svém aktivním místě aminokyselinový serin. Mezi členy této rodiny patří trávicí proteázy trypsin a chymotrypsin spolu s prolyl endopeptidázou. Jeden inhibitor používaný často v biochemických výzkumných laboratořích je vysoce toxický sloučenina fenylmethanesulfonylflourid (PMSF). Používá se během izolace a čištění proteinů k inhibici serinové proteázové aktivity, která může degradovat protein, který je purifikován.

cysteinové proteázy mají na svém aktivním místě skupinu síry a jsou běžné v ovoci. Tyto enzymy se nacházejí v dřevěných látkách. Papain je příkladem takové endopeptidázy a používá se k léčbě včel a vosy STIngs.

Aktivní místo aspartických proteáz obecně obsahuje dvě skupiny aspartátu. Metalloendopeptidázy vyžadují pro aktivitu kovový kofaktor. Neutrální endopeptidázy jsou součástí této rodiny a vyžadují zinku pro aktivitu.