Hvad er en endopeptidase?

En endopeptidase er en type protease, et enzym fra en stor gruppe, der forringer proteiner.Enzymer er proteiner, der får reaktioner til at ske meget hurtigere.Proteiner består af kæder af aminosyrer, forbundet med peptidbindinger.Denne binding forbinder carboxylterminalen af den ene aminosyre med den næste aminosætning.Endopeptidaser spaltes peptidbindingerne af aminosyrerne i proteinet, i modsætning til Eksopeptidaser , der spalter i enderne af proteinet.

Endopeptidaser findes i alle klasser af organismer og har en lang række biologiske aktiviteter.De er involveret i fordøjelsen af protein i mad.Dette inkluderer enzymerne pepsin, trypsin og chymotrypsin.Proteaser er også involveret i cellulær signalering ved at nedbryde andre proteiner, såsom antistoffer eller hormoner.De kan tænde eller slukke veje.

Proteaser fremstilles normalt først som et større molekyle, der er inaktivt.Dette beskytter cellen, der syntetiserer den mod at blive beskadiget.Når proteasen er blevet leveret til sit mål, for eksempel maven, fjernes et stykke af molekylet.Dette aktiverer proteasen.

På grund af deres utal af roller i cellulær funktion er der meget medicinsk interesse i endopeptidaseaktivitet.Et eksempel på dette er prolylendopeptidase, der spalter specifikt efter aminosyreprolinen.Det har været forbundet med psykologiske lidelser, såsom depression, mani og skizofreni.Der er klinisk interesse i prolylendopeptidaseinhibitorer som mulige antidepressiva.

Et andet eksempel er neutral endopeptidase, der har flere andre navne.Det er også kendt som Neprilysin og almindelig akut lymfoblastisk leukæmi -antigen (Calla).Denne protease forringer små udskilte peptider, inklusive peptidet, der er blevet impliceret som en årsag til Alzheimers sygdom, og adskillige vigtige signalpeptider.Neutral endopeptidase bruges undertiden som en kræftmarkør, men dens rolle i kræft er uklar.Inhibitorer er blevet udviklet til at hjælpe med smertelindring og kontrol af højt blodtryk.

Endopeptidaserne er placeret i forskellige familier, afhængigt af strukturen på deres aktive sted og de betingelser, de foretrækker.Der er serinproteaser, der har aminosyreserin på deres aktive sted.Medlemmer af denne familie inkluderer fordøjelsesproteaserne trypsin og chymotrypsin sammen med prolylendopeptidase.En inhibitor, der ofte bruges i biokemiske forskningslaboratorier, er den meget giftige sammensatte phenylmethanesulfonylflourid (PMSF).Det bruges under proteinisolering og oprensning til at hæmme serinproteaseaktivitet, som kan nedbryde proteinet, der renses.

Cysteinproteaser har en svovlgruppe på deres aktive sted og er almindelige i frugt.Disse enzymer findes i kødudbydere.Papain er et eksempel på en sådan endopeptidase og bruges til behandling af BEE- og WASP -stings.

Det aktive sted for aspartiske proteaser indeholder generelt to aspartatgrupper.Metalloendopeptidaser kræver en metalcofaktor til aktivitet.Neutrale endopeptidaser er en del af denne familie, der kræver zink til aktivitet.