Hva er ribosomal RNA -sekvensering?

ribosomal ribonukleinsyre (RNA) sekvensering er prosessen med å bestemme sekvensinnholdet i nukleinsyrene som utgjør ribosomet. I nesten alle celler er ribosomer makromolekyler som bygger proteiner for å holde cellen i gang. De består av RNA og en rekke proteiner som hjelper RNA til å fungere mer effektivt. Mye av dette materialet i et ribosom er direkte involvert i proteinbygging, så det å bestemme ribosomal RNA -sekvensering kan gi innsikt om molekylets endelige struktur, samt hvordan det fungerer. Funksjonen og den generelle strukturen til RNA er godt bevart mellom en rekke arter, men den rå sekvensen er ikke, og endringer i sekvensen kan brukes til å utlede informasjon om ribosomets utvikling.

Uansett om det brukes til bakterielle ribosomer eller de med mer komplekse organismer, oppnås ribosomal RNA -sekvensering på en lignende måte. Når RNA er atskilt fra ribosomet, er det duplisert mange ganger, og deretter brutt fra hverandre i lite fragments hvis sekvenser lett kan identifiseres. De små sekvensstykkene blir deretter satt sammen for å generere den nybestemte sekvensen. Oppgaven blir mer komplisert etter hvert som en sekvens blir lengre, men prosessen er fremdeles relativt enkel for ribosomalt RNA, som er relativt liten. Det er ingen garanti for at et første forsøk på ribosomal RNA -sekvensering vil være riktig første gang, så flere forsøk på å bekrefte datakvaliteten blir vanligvis utført.

Data hentet fra ribosomal RNA -sekvensering kan brukes til en rekke formål, men en av de vanligste er for bakteriell identifikasjon. Spesielt bakteriell ribosomalt RNA er sterkt bevart mellom arter, så sekvensering gjør at de unike egenskapene til en art kan konsolideres til en profil for referanse. Denne profilen kan brukes til å raskt og enkelt identifisere en bestemt type bakterier, en test som kanHjelp til diagnose og behandling av syke. Med bruk av bedre sekvenseringsteknologi har denne tilnærmingen blitt mer vanlig i diagnoser.

En annen påvirknings ribosomal RNA -sekvensering kan ha på menneskers helse for å hjelpe utformingen av medisiner og medisiner. Bakterielle ribosomale RNA -sekvenser har mange sekvenser som er unike for bakterier, så målretting av disse regionene med antimikrobielle medisiner kan drepe bakterier uten å være skadelig for mennesker. Ribosomale RNA -sekvenseringsdata på egen hånd gir ikke nok data til å lage medisiner, men det gir forskeregioner å fokusere på for fremtidig studie og medikamentdesign. Medisinske molekyler kan konstrueres som fester seg til sekvensene og deaktiverer ribosomet. En rekke aktuelle medisiner bruker denne teknikken for å bekjempe sykdom.