Hva er ribosomal RNA-sekvensering?

RNA-sekvensering av ribosomal ribonukleinsyre er prosessen for å bestemme sekvensinnholdet i nukleinsyrene som utgjør ribosomet. I nesten alle celler er ribosomer makromolekyler som bygger proteiner for å holde cellen i gang. De består av RNA og en rekke proteiner som hjelper RNA å jobbe mer effektivt. Mye av dette materialet i et ribosom er direkte involvert i proteinbygging, så å bestemme ribosomal RNA-sekvensering kan gi innsikt i molekylets endelige struktur, samt hvordan det fungerer. Funksjonen og den generelle strukturen til RNA er godt bevart mellom en rekke arter, men den rå sekvensen er ikke, og endringer i sekvensen kan brukes til å utlede informasjon om ribosomets utvikling.

Enten det brukes til bakterielle ribosomer eller for mer komplekse organismer, oppnås ribosomal RNA-sekvensering på lignende måte. Når RNA er separert fra ribosomet, dupliseres det mange ganger, og brytes deretter i små fragmenter hvis sekvenser lett kan identifiseres. Disse små sekvensstykkene blir deretter satt sammen igjen for å generere den nylig bestemte sekvensen. Oppgaven blir mer komplisert etter hvert som en sekvens blir lengre, men prosessen er fremdeles relativt enkel for ribosomalt RNA, som er relativt lite. Det er ingen garanti for at et første forsøk på ribosomal RNA-sekvensering vil være riktig første gang, så det utføres vanligvis flere forsøk på å verifisere datakvaliteten.

Data oppnådd fra ribosomal RNA-sekvensering kan brukes til en rekke formål, men en av de mest vanlige er for bakteriell identifikasjon. Bakterielt ribosomalt RNA er spesielt konservert mellom arter, så sekvensering gjør at de unike egenskapene til en art kan konsolideres til en profil for referanse. Denne profilen kan brukes til å raskt og enkelt identifisere en spesifikk type bakterier, en test som kan hjelpe til med diagnostisering og behandling av syke. Med bruk av bedre sekvenseringsteknologi har denne tilnærmingen blitt mer vanlig i diagnoser.

En annen innvirkning av ribosomal RNA-sekvensering på menneskers helse er å hjelpe utformingen av medisiner og medisiner. Bakterielle ribosomale RNA-sekvenser har mange sekvenser som er unike for bakterier, så å målrette disse regionene med antimikrobielle medisiner kan drepe bakterier uten å være skadelig for mennesker. Ribosomal RNA-sekvenseringsdata på egen hånd gir ikke nok data til å lage medisiner, men det gir forskere regioner å fokusere på for fremtidig studie og medikamentdesign. Medisinske molekyler kan konstrueres som fester seg til sekvensene og deaktiverer ribosomet. En rekke aktuelle medisiner bruker denne teknikken for å bekjempe sykdom.