Co je ribozomální RNA sekvenování?

Sekvenování ribosomální ribonukleové kyseliny (RNA) je proces určování sekvenčního obsahu nukleových kyselin, které tvoří ribozom. Téměř ve všech buňkách jsou ribozomy makromolekuly, které vytvářejí proteiny, aby udržely běh buněk. Skládají se z RNA a různých proteinů, které pomáhají RNA pracovat efektivněji. Většina tohoto materiálu v ribozomu se přímo podílí na tvorbě bílkovin, takže stanovení sekvenování ribozomální RNA může poskytnout informace o konečné struktuře molekuly a také o tom, jak funguje. Funkce a obecná struktura RNA je dobře zachována mezi různými druhy, ale surová sekvence není a změny v sekvenci lze použít k odvození informace o vývoji ribozomu.

Ať už se používá pro bakteriální ribozomy nebo ty složitějších organismů, je ribozomální RNA sekvenování prováděno podobným způsobem. Jakmile je RNA oddělena od ribozomu, je mnohokrát duplikována a poté rozdělena na malé fragmenty, jejichž sekvence lze snadno identifikovat. Tyto malé kousky sekvence se poté znovu sestaví, aby se vytvořila nově určená sekvence. Úloha se stává složitější, protože sekvence se prodlužuje, ale proces je stále relativně snadný pro ribozomální RNA, která je poměrně malá. Neexistuje žádná záruka, že první pokus o sekvenování ribozomální RNA bude správný poprvé, takže se obvykle provádí více pokusů o ověření kvality dat.

Data získaná ze sekvenování ribozomální RNA mohou být použita pro různé účely, ale jedním z nejčastějších je bakteriální identifikace. Obzvláště bakteriální ribozomální RNA je mezi druhy vysoce konzervativní, takže sekvenování umožňuje, aby byly jedinečné vlastnosti druhu konsolidovány do profilu pro referenci. Tento profil lze použít k rychlé a snadné identifikaci konkrétního typu bakterie, což je test, který může pomoci při diagnostice a léčbě nemocných. S příchodem lepší technologie sekvencování se tento přístup stal běžnějším v diagnostice.

Druhé dopady ribozomální RNA sekvence na lidské zdraví mohou napomáhat při navrhování léků a léčiv. Bakteriální ribozomální RNA sekvence mají mnoho subsekvencí, které jsou jedinečné pro bakterie, takže zacílení na tyto oblasti pomocí antimikrobiálních léků může zabíjet bakterie, aniž by to bylo na újmu pro člověka. Samotné údaje o sekvenování ribozomální RNA neposkytují dostatek údajů pro vytváření léků, ale vědcům poskytují regiony, aby se zaměřili na budoucí studium a návrh léků. Mohou být vytvořeny léčivé molekuly, které se připojují k sekvencím a deaktivují ribozom. Různé techniky používají tuto techniku ​​k boji proti nemocem.