Co je sekvenování ribozomální RNA?

Sekvenování

ribozomální kyseliny ribonukleové (RNA) je proces stanovení sekvenčního obsahu nukleových kyselin, které tvoří ribozom. Téměř ve všech buňkách jsou ribozomy makromolekuly, které staví proteiny, aby buňka udržovala v chodu. Jsou tvořeny RNA a řadou proteinů, které pomáhají RNA fungovat efektivněji. Většina tohoto materiálu v ribozomu je přímo zapojena do budování proteinů, takže určení sekvenování ribozomálních RNA může poskytnout informace o konečné struktuře molekuly a také o tom, jak to funguje. Funkce a obecná struktura RNA jsou dobře zachována mezi různými druhy, ale surová sekvence není a změny v sekvenci lze použít k odvození informací o evoluci ribozomu.

Ať už se používá pro bakteriální ribozomy nebo o složitějších organismech, ribozomální sekvenování RNA se provádí podobným způsobem. Jakmile je RNA oddělena od ribozomu, je mnohokrát duplikována a poté se rozdělí na malý fragmentS, jejichž sekvence lze snadno identifikovat. Tyto malé sekvenční kusy jsou poté znovu sestaveny, aby se vytvořila nově stanovená sekvence. Úkol se stává komplikovanějším, když se sekvence prodlužuje, ale proces je stále relativně snadný pro ribozomální RNA, která je poměrně malá. Neexistuje žádná záruka, že první pokus o sekvenování ribozomální RNA bude poprvé správný, takže se obvykle provádí několik pokusů o ověření kvality dat.

Data získaná z ribozomálního sekvenování RNA lze použít pro různé účely, ale jednou z nejčastějších je bakteriální identifikaci. Zejména bakteriální ribozomální RNA je mezi druhy vysoce konzervovaná, takže sekvenování umožňuje konsolidaci jedinečných vlastností druhu do profilu pro informaci. Tento profil lze použít k rychlé a snadné identifikaci konkrétního typu bakterií, testu, který můžePomoc při diagnostice a léčbě nemocných. S příchodem technologie lepší sekvenování se tento přístup stal v diagnózách běžnější.

Druhý dopad sekvenování ribozomálních RNA může mít na lidské zdraví napomáhá návrhu léčiv a léčiv. Bakteriální ribozomální sekvence RNA mají mnoho následků, které jsou pro bakterie jedinečné, takže zaměření na tyto oblasti antimikrobiálními léky může bakterie zabíjet, aniž by bylo pro lidi škodnutí. Samotná data sekvenování ribozomálních RNA neposkytují dostatek dat pro vytváření léčivých přípravků, ale poskytuje vědcům regiony, na které se mohou zaměřit na budoucí studium a návrh léčiv. Léčivé molekuly mohou být navrženy, které se připevňují k sekvencím a deaktivují ribozom. Různé současné léky používají tuto techniku ​​k boji proti onemocněním.