O que é um banco de dados do genoma?

Um genoma é uma coleção de todo o material genético presente em um organismo. À medida que a sequência e a estrutura desse material genético impulsionam toda a vida biológica, os cientistas estão muito interessados ​​em descobrir o que todos eles são. Um banco de dados do genoma é uma coleção cruzada de informações sobre um ou mais organismos, para que um cientista possa analisar todas as informações genéticas disponíveis para ajudá-lo na pesquisa.

Os genomas são altamente complexos e contêm bilhões de bases na sequência de informações. Os bancos de dados computadorizados, portanto, são a única maneira prática de organizar os detalhes em um só lugar. Geralmente, eles estão disponíveis como bancos de dados on -line para pesquisa científica. Um campo relativamente novo da ciência, chamado bioinformática, surgiu para aperfeiçoar a maneira como os dados biológicos podem ser interpretados através de sistemas de computador.

Os bancos de dados de genomas contêm a sequência dos genes de um organismo se a sequência inteira for conhecida. Caso contrário, ele pode conter PASequências Rtial. Os genomas humanos, ratos e Drosophila fly foram sequenciados, por exemplo. Quando a sequência de um genoma é conhecida, os geneticistas podem identificar genes específicos no genoma. Cada gene é a folha de instruções para um produto de célula específico.

Se um gene tiver uma mutação, ele tem uma sequência diferente do gene funcional normal. Mutações podem ser benéficas e produzir uma característica útil no organismo mutado. Eles também não podem fazer diferença para o produto, ou podem ser prejudiciais ao funcionamento normal do organismo. Muitas condições médicas, por exemplo, são devidas a mutações em um gene específico.

Mutações também podem ser usadas para calcular o quão intimamente relacionado uma espécie em particular é de outra, à medida que mais mutações se acumulam com o tempo. Os indivíduos também podem variar na sequência do genoma, especialmente porque grandes partes do genoma não são genes e não codificam Fou qualquer produto celular essencial. Um banco de dados do genoma mantém uma sequência de um organismo designado como padrão, mas haverá muitas pequenas diferenças entre o padrão arbitrariamente escolhido e os outros indivíduos em uma espécie.

Apesar da presença de muitas diferenças, os genes são reconhecíveis por meio de sequências. Se os geneticistas sabem o que um gene específico faz em um organismo, um gene com uma sequência semelhante em outro animal provavelmente desempenha a mesma função. Os geneticistas podem usar um banco de dados do genoma para identificar um gene que estão estudando ou para descobrir o que o gene faz.

Cada banco de dados do genoma é pesquisado. Geralmente, os cientistas podem pesquisar um banco de dados uma das várias maneiras diferentes. Geralmente, ele ou ela pode inserir a sequência de um gene que ele ou ela se sequenciou. Em seguida, o banco de dados encontra uma ou mais seqüências semelhantes para comparação.

Uma maneira mais simples de pesquisar no banco de dados envolve procurar uma palavra -chave gene, como o nome do gene. UMUthorities, como a Autoridade Nacional de Informações sobre Biotecnologia dos EUA (NCBI), podem fornecer a sequências números de referência distintos, e um geneticista também pode pesquisar um banco de dados de genoma usando um desses identificadores. Ele também pode restringir os resultados usando mais parâmetros de pesquisa. As informações de referência cruzada são um recurso da maioria dos bancos de dados do genoma, e um único resultado de sequência também fornecerá ao usuário do banco de dados links úteis para obter mais informações genéticas. Além de informações sobre uma sequência específica, muitos bancos de dados fornecem uma representação visual da sequência e dos recursos notáveis ​​dessa área.

Diferentes organismos podem ter bancos de dados específicos do genoma, mas alguns bancos de dados maiores contêm mais de uma espécie. Várias autoridades controlam os diferentes bancos de dados disponíveis, para que todos os bancos de dados possam usar formatos distintos e recursos de pesquisa. Alguns exemplos dessas autoridades incluem o NCBI, o Instituto Europeu de Bioinformática, ou mesmo a Universidade Individuales.

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