Co je to genomická knihovna?

Genomická knihovna je sbírka bakterií, které byly geneticky upraveny tak, aby pojaly celou DNA organismu. Velikost knihovny se liší v závislosti na tom, jak je DNA uložena v bakterii, a na délce genomu organismu. Genomické knihovny se používají v genetickém výzkumu po celém světě v různých laboratorních zařízeních. Společnosti, které vyrábějí genomické knihovny, je mohou poskytovat na zvláštní objednávku výzkumníkům.

Sestavení genomické knihovny začíná ošetřováním DNA zkoumaného organismu tak, aby se rozpadla na zvládnutelné kousky, které jsou uspořádány podle délky a poté byly vloženy do klonovacích vektorů, jako jsou plazmidy. Různé vektory mohou ukládat různá množství DNA. Jakmile je DNA vložena, může být vektor zaveden do bakterií. Sběr bakterií společně drží celý genom organismu.

Jakmile je vytvořena genomická knihovna, mohou s ní vědci pracovat různými způsoby. Například mohou hledat specifické řetězce DNA v knihovně pomocí sond, které jsou navrženy pro identifikaci a značení specifických aminokyselinových sekvencí. Pomocí sondy lze izolovat sekvence pro další studium a analýzu, aby se dozvěděly více o konkrétních oblastech zájmu v genomu. Genomická knihovna může být také uložena, zmrazena, pro budoucí použití. Dokud je udržován ve stabilních podmínkách, může trvat velmi dlouhou dobu.

Pomocí genomické knihovny mohou vědci prozkoumat genom organismu a dozvědět se více o genomické struktuře a funkci. Mohou také mapovat genom a identifikovat umístění specifických genů. Tato informace se stává velmi užitečnou, pokud vědci chtějí vyvinout testy, které lze použít k nalezení genetických variací, včetně mutací, které mohou souviset s vrozenými podmínkami. Čím hlouběji porozumíte genomu organismu, tím více vědců může vědět o organismu jako celku.

Klonování segmentů DNA lze také použít genomickou knihovnu. Vektory v hostitelských bakteriích mohou být replikovány hostitelem tak, aby vytvořily řadu kopií segmentu zájmu, přičemž tyto kopie jsou dále studovány nebo vloženy do jiných vektorů pro genetickou modifikaci a další výzkumné účely. Například klonované materiály by mohly být vloženy do plodin za účelem zavedení specifických modifikací s cílem zlepšit výkonnost plodin.