Quels sont les différents types de workflows scientifiques?
Les flux de travail scientifiques sont utilisés pour améliorer les méthodes de recherche. Les types les plus courants concernent les flux de travail de laboratoire, les flux de calcul et les flux de travail d'analyse de données. De nombreuses institutions développent des workflows scientifiques pour réduire les erreurs, améliorer les résultats et accélérer la découverte. Les flux de travail sont souvent conçus sur mesure pour des études spécifiques et peuvent varier en fonction du secteur d'activité et du type de données à collecter et à analyser.
Les flux de travail scientifiques du laboratoire peuvent couvrir plusieurs aspects des opérations. Dans de nombreux établissements, il existe des processus spécifiques pour préparer un échantillon à tester. Par exemple, une clinique hospitalière peut avoir des procédures bien définies pour obtenir un échantillon de patient, enregistrer cet échantillon, le suivre à l'aide d'un scanner et d'un code à barres, le stocker et le préparer pour l'examen. Dans ce cas, le flux de travail scientifique pourrait être une combinaison de procédures écrites à suivre et de logiciels permettant de suivre l’échantillon, de la collecte à l’examen. Les informations sur l'état d'un échantillon sont souvent mises à disposition via un portail Web pour un accès facile. Les opérations de laboratoire utilisent également des flux de travail pour garantir la disponibilité des matériaux nécessaires, tels que les réactifs chimiques nécessaires pour effectuer un test, sont en stock et disponibles lors de la réalisation d'une expérience.
Une autre forme de flux de travail scientifique pour le laboratoire concerne la réalisation de l'expérience réelle. Par exemple, un chercheur peut vouloir photographier une certaine région du ciel ou séquencer l'ADN d'une cellule particulière. Dans les deux cas, un flux de travail dictera les étapes qu'un chercheur suivrait pour compléter l'observation. Par exemple, les astronomes devraient obtenir les coordonnées de la région qu'ils souhaitent étudier, saisir ces données dans le système de suivi du télescope et positionner une caméra numérique pour capturer une image. Une institution pourrait utiliser ces flux de travail pour programmer du temps sur du matériel spécial afin de garantir une utilisation optimale de ce matériel.
Aujourd'hui, de nombreuses recherches sont effectuées au moyen de la modélisation et de la simulation sur ordinateur. Les flux de travail scientifiques pour ce type de recherche peuvent inclure des procédures pour créer le programme, le dépanner, puis soumettre et exécuter ces travaux de calcul. Dans de nombreux laboratoires, un chercheur peut soumettre un travail en ligne à un centre informatique. Les travaux sont ensuite automatiquement planifiés en fonction de divers facteurs, notamment le niveau de priorité, les ressources disponibles et la durée d'exécution du travail. Dans la plupart des cas, les informations sur le statut des travaux sont disponibles en ligne. Ainsi, ceux qui ont soumis un travail peuvent rapidement vérifier son statut pour voir s'il est planifié pour être exécuté ou exécuté.
Une fois qu'une expérience est terminée, qu'un test de laboratoire est terminé ou qu'une simulation est effectuée, il est souvent nécessaire de recourir à un autre type de flux de travail scientifique pour analyser les données collectées. Souvent, la première étape d'un tel processus d'analyse scientifique consiste à extraire les données d'une base de données, d'un fichier ou d'un site Web spécifique. Les données doivent ensuite être placées dans un format approprié. Cela pourrait être quelque chose d'aussi simple que de convertir une lecture de la température en degrés Fahrenheit en degrés Celsius ou une mesure de distance en pieds de milles. Les données sont ensuite analysées et peuvent nécessiter une comparaison avec d’autres données. Les résultats finaux sont ensuite présentés au chercheur, généralement sous la forme d'un rapport, d'un fichier ou d'un affichage.
Dans tous ces types de flux de travail scientifiques, l'avantage est que les recherches disposent de moyens standardisés pour mener leurs travaux. Dans certains cas, l'automatisation peut être appliquée à certaines des étapes d'un flux de travail. L'automatisation aide à décharger le chercheur et à accélérer le processus.