In de biologie, wat is Nick-vertaling?
Op het gebied van biologie is nick-translatie een proces dat wordt gebruikt om bepaalde moleculen die DNA-strengen vormen te vervangen door vergelijkbare moleculen die een specifiek, gewenst kenmerk produceren, vaak een kenmerk waarmee deze moleculen gemakkelijk kunnen worden gespot en geïdentificeerd tijdens een experiment. Een enzym bekend als DNA-polymerase I zorgt ervoor dat bepaalde DNA-moleculen, bekend als nucleotiden, worden vervangen door nieuwe nucleotiden. De nieuwe nucleotiden worden specifiek gekozen door de wetenschappers die het experiment uitvoeren.
Vaak wordt nick-vertaling gebruikt voor wetenschappelijke procedures zoals blotting. Dit omvat het isoleren en onderzoeken van DNA-stammen om te bepalen uit welke nucleotiden het bestaat en vervolgens experimenten op de specifieke DNA-streng uit te voeren. Leren over verschillende DNA-sequenties kan helpen een mutatie te isoleren of een antilichaam te maken om een virus te bestrijden.
Het proces van nick-translatie omvat zogenaamde restrictie-enzymen die worden gebruikt om insnijdingen of "inkepingen" in de DNA-sequentie te maken. Een restrictie-enzym is ontworpen om een DNA-sequentie op een specifieke locatie te knippen en is een soort afweermechanisme dat wordt gebruikt om schadelijke virussen te vernietigen. Wetenschappers zetten het restrictie-enzym in om stukken van het DNA te snijden, zodat ze deze kunnen vervangen door nieuwe stukken.
Zodra de inkepingen zijn gemaakt, worden specifieke enzymen gebruikt om het DNA te repareren met speciale nucleotiden die zijn ontworpen om het bestuderen van het DNA gemakkelijker te maken. Wetenschappers bestuderen deze nieuwe DNA-sequentie om te zien hoe deze reageert op zichzelf of andere objecten, en het hebben van deze getagde nucleotiden vereenvoudigt het proces van nauwlettend volgen en bestuderen van de DNA-streng. Een bekend voorbeeld is het inbrengen van getagde nucleotiden die gloeien wanneer ze onder een zwart licht worden geplaatst, waardoor ze gemakkelijk te herkennen zijn.
Een ander gebruikelijk voorbeeld van een van de vele toepassingen van nick-translatie is fluorescerende in situ hybridisatie. Met dit proces kan een wetenschapper naar specifieke DNA-sequenties zoeken om te zien of deze al dan niet aanwezig zijn in een DNA-streng. Nick-vertaling kan deze strengen DNA-fluorescerende eigenschappen geven zodat ze gloeien en de wetenschapper kan dit gebruiken om te helpen identificeren welke DNA-sequenties aanwezig zijn en welke afwezig zijn.
Nucleotiden verwijderd en vervolgens vervangen door nick-vertaling worden vaak "junk-DNA" genoemd. Wetenschappers hebben nog geen enkel doel kunnen vinden dat deze DNA-moleculen dienen. Ze lijken niet te werken en dragen de code voor geen enkele soort eiwit, zoals typisch is voor het meest bruikbare DNA.