Vad är Nick-översättning i biologi?

På området biologi är nick-översättning en process som används för att ersätta vissa molekyler som utgör strängar av DNA med liknande molekyler som ger en specifik, önskad egenskap, ofta en egenskap som gör att dessa molekyler lätt kan upptäckas och identifieras under ett experiment. Ett enzym känt som DNA-polymeras I får vissa DNA-molekyler, kända som nukleotider, att ersättas med nya nukleotider. De nya nukleotiderna väljs specifikt av forskarna som utför experimentet.

Ofta används nick-översättning för vetenskapliga procedurer som blotting. Detta innebär att isolera och undersöka DNA-stammar för att bestämma vilka nukleotider det består av och sedan utföra experiment på den specifika DNA-strängen. Att lära sig om olika DNA-sekvenser kan hjälpa till att isolera en mutation eller skapa en antikropp för att bekämpa ett virus.

Processen för nick-translation involverar vad som kallas restriktionsenzymer som används för att göra nedskärningar eller "nicks" på DNA-sekvensen. Ett restriktionsenzym är utformat för att skära en DNA-sekvens på en specifik plats och är en typ av försvarsmekanism som används för att förstöra skadliga virus. Forskare sätter restriktionsenzymet att arbeta med att skär bitar av DNA så att de kan ersätta dem med nya bitar.

När nicks är gjorda, används specifika enzymer för att reparera DNA med speciella nukleotider utformade för att underlätta studien av DNA. Forskare studerar den nya DNA-sekvensen för att se hur den reagerar på sig själv eller andra föremål, och att ha dessa märkta nukleotider förenklar processen för att noga övervaka och studera DNA-strängen. Ett vanligt exempel är införandet av märkta nukleotider som kommer att glöda när de placeras under ett svart ljus, vilket gör dem lätta att upptäcka.

Ett annat vanligt exempel på en av de många användningarna av nick-translation är fluorescerande in situ-hybridisering. Denna process gör det möjligt för en forskare att leta efter specifika DNA-sekvenser för att se om de finns i en DNA-sträng eller inte. Nick-översättning kan ge dessa strängar av DNA-fluorescerande egenskaper så att de glöder och forskaren kan använda detta för att hjälpa till att identifiera vilka DNA-sekvenser som finns och vilka som saknas.

Nukleotider som tas bort och sedan ersätts genom nick-översättning benämns ofta "skräp-DNA." Forskare har ännu inte lyckats hitta något slags syfte som dessa DNA-molekyler tjänar. De verkar inte fungera och bär inte koden för någon form av protein, vilket är typiskt för mest användbart DNA.