W biologii, czym jest tłumaczenie nicków?

W dziedzinie biologii translacja nicków jest procesem stosowanym w celu zastąpienia niektórych cząsteczek tworzących nici DNA podobnymi cząsteczkami, które wytwarzają określoną, pożądaną cechę, często cechę, która umożliwia łatwe wykrycie i identyfikację tych cząsteczek podczas eksperymentu. Enzym znany jako Polimeraza DNA I powoduje, że niektóre cząsteczki DNA, zwane nukleotydami, są zastępowane nowymi nukleotydami. Nowe nukleotydy są wybierane specjalnie przez naukowców przeprowadzających eksperyment.

Często tłumaczenie nick jest używane w procedurach naukowych, takich jak blotting. Obejmuje to izolowanie i badanie szczepów DNA w celu ustalenia, z czego składa się nukleotyd, a następnie przeprowadzanie eksperymentów na konkretnej nici DNA. Poznanie różnych sekwencji DNA może pomóc w wyizolowaniu mutacji lub wytworzeniu przeciwciała do walki z wirusem.

Proces translacji nicków obejmuje tak zwane enzymy restrykcyjne stosowane do wykonywania cięć lub „nacięć” w sekwencji DNA. Enzym restrykcyjny jest zaprojektowany do cięcia sekwencji DNA w określonym miejscu i jest rodzajem mechanizmu obronnego stosowanego do niszczenia szkodliwych wirusów. Naukowcy zastosowali enzym restrykcyjny do cięcia kawałków DNA, aby mogli je zastąpić nowymi kawałkami.

Po wytworzeniu nacięć używa się specyficznych enzymów do naprawy DNA za pomocą specjalnych nukleotydów zaprojektowanych w celu ułatwienia badania DNA. Naukowcy badają tę nową sekwencję DNA, aby zobaczyć, jak reaguje ona na siebie lub inne obiekty, a posiadanie tych znakowanych nukleotydów upraszcza proces ścisłego monitorowania i badania nici DNA. Typowym przykładem jest wstawienie znakowanych nukleotydów, które będą świecić po umieszczeniu w czarnym świetle, dzięki czemu są łatwe do wykrycia.

Innym częstym przykładem jednego z wielu zastosowań translacji nicków jest hybrydyzacja fluorescencyjna in situ. Ten proces pozwala naukowcom szukać określonych sekwencji DNA, aby sprawdzić, czy są one obecne w nici DNA. Translacja nicka może nadać tym niciom właściwości fluorescencyjne DNA, dzięki czemu będą świecić, a naukowiec może to wykorzystać, aby zidentyfikować, które sekwencje DNA są obecne, a które nie.

Nukleotydy usunięte, a następnie zastąpione przez translację nicka są często nazywane „śmieciowym DNA”. Naukowcy nie byli jeszcze w stanie znaleźć żadnego celu, któremu służą te cząsteczki DNA. Wydają się nie działać i nie zawierają kodu żadnego rodzaju białka, co jest typowe dla najbardziej przydatnego DNA.