Vad är DNA Microarray?
DNA-mikroarray-teknik används i genetisk och medicinsk forskning för att ge forskare möjlighet att studera aktiviteten hos flera tusen gener samtidigt, liksom förhållandet mellan dem. Tidigare kunde forskare bara analysera några få gener samtidigt. Med introduktionen av DNA-mikroteknologi kan aktiviteten hos tusentals gener övervakas samtidigt. Några av de hälsotillstånd som forskare använder denna teknik för att undersöka genaktivitet inkluderar hjärtsjukdomar, cancer och fetma. Det gör det också möjligt för forskare att klassificera cancer baserat på var de har sitt ursprung, och mönstret för genaktivitet i tumörcellen.
En DNA-mikroarray består av en bildstämpel som innehåller molekyler kända som DNA, den genetiska koden för en organisme eller en av dess delar. DNA: et placeras på objektglaset i en specifik sekvens och i ett mönster av horisontella och vertikala linjer med jämna mellanrum av en robotmaskin. Den specifika sekvensen och avståndet till DNA gör det möjligt för forskare att veta sekvensen för den eller de gener som används.
Innan en forskare kan mäta aktiviteten för en gen på bilden måste ett vävnadsprov från en patient, vanligtvis blod, samlas in. Vävnadsprovet placeras i en lösning och möjliggör insamling av mRNA, en produkt från en uttryckt gen som transporterar information från en kärna till andra delar av en cell för att göra proteiner. MRNA är komplement till DNA-strängen som den kopierades från.
När mRNA samlats in kommer en forskare att binda ett fluorescerande färgämne till mRNA och det kommer att placeras på objektglaset av en robotmaskin. Det mRNA som är komplement till DNA kommer att binda med dess komplement. Eftersom sekvensen för DNA som placerades på bilden är känd, indikerar mRNA som binder med DNA den specifika DNA-sekvensen som uttrycks i cellen.
För att se generna kommer en skanner att mäta de fluorescerande områdena i DNA-mikroarrayen. Ljusstyrkan hos det fluorescerande färgämnet visar aktiviteten hos en gen och frånvaron av fluorescerande färgämne indikerar att en gen inte är aktiv. Därför, ju ljusare det fluorescerande färgämnet är, desto mer aktiv är genen. Ju lättare det fluorescerande färgämnet är, desto mindre aktiv är genen.
Att känna till en genaktivitet kan hjälpa dig att avgöra om en gen som är överuttryckt kan orsaka en specifik sjukdom. I en klinisk miljö, om överuttrycket av en gen redan har bestämts för att orsaka en specifik sjukdom, kan ett vävnadsprov tas från en patient och en forskare kan använda DNA-mikroarray-tekniken för att mäta uttrycket av den målinriktade genen för att bestämma om en specifik gen kan vara orsaken till sjukdomen som patienten har. DNA-mikroarray är ett kraftfullt sätt att bestämma vilka gener som är involverade i att orsaka en specifik sjukdom.