Wat zijn de verschillende soorten virussen?
Virussen zijn kleine stukjes genetisch materiaal, verpakt in eiwitomhulsels, in staat om de cellulaire machines van planten, dieren en bacteriën te kapen voor zelfreplicatie. Ze zijn extreem klein, veel kleiner dan bacteriën. Een typisch virus is tussen de 10 en 300 nanometer (miljardste van een meter) groot, terwijl typische bacteriën groter zijn dan een micrometer (miljoenste van een meter).
Slechts ongeveer 30.000 soorten virussen worden gevolgd door virologen, hoewel er waarschijnlijk miljoenen bestaan. Virale classificatie wordt bemoeilijkt door een gebrek aan fossiel bewijs - virussen fossiliseren slecht - en controverse over de vraag of ze levende organismen zijn of niet. In tegenstelling tot andere organismen, ontstaan soms nieuwe virussen uit de genomen van reeds bestaande organismen, waardoor het moeilijk is om coherente stambomen te bouwen. Dit belet echter niet dat virologen het proberen.
Een uniforme taxonomie voor virussen werd pas in 1966 ontwikkeld door de International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV). Dit classificatieschema is geïnspireerd op het Linnaean-classificatiesysteem voor andere organismen. Het bevat vijf niveaus: orde, familie, subfamilie, geslacht en soort. De erkenning van het bestelniveau is uiterst recent, met slechts drie genoemde bestellingen. De meeste virale families zijn nog niet in willekeurige volgorde geplaatst. Momenteel herkent de ICTV slechts ongeveer 1.550 soorten.
Bijvoorbeeld, het waterpokkenvirus, Varicella zoster (VZV), behoort tot de familie Herpesviridae , subfamilie Alphaherpesvirinae, het geslacht Varicellovirus , en mist een op volgorde gebaseerde indeling.
Een tweede classificatieschema, Baltimore Classification, ontwikkeld door en genoemd naar Nobelprijswinnende bioloog David Baltimore, wordt vaak gebruikt in combinatie met het ICTV-systeem. Het classificatiesysteem van Baltimore categoriseerde virussen op basis van waar ze van zijn gemaakt. Hier is het schema:
Groep | bevat |
ik | dubbelstrengs DNA-virussen |
II | enkelstrengige DNA-virussen |
III | dubbelstrengs RNA-virussen |
IV | (+) enkelstrengige RNA-virussen |
V | (-) enkelstrengige RNA-virussen |
VI | dubbelstrengige reverse-transcriberende virussen |
VII | dubbelstrengige reverse-transcriberende virussen |
Door deze twee classificatiesystemen samen te gebruiken, kunnen virologen daadwerkelijk een idee hebben waar elkaar het over hebben. Een ander traditioneel classificatiesysteem is gebaseerd op het soort organisme dat ze infecteren: er zijn plantenspecifieke virussen, dierspecifieke virussen en bacteriespecifieke virussen, bacteriofagen genoemd. Afhankelijk van de host die het virus heeft ontwikkeld om te infecteren, heeft het een andere fysieke structuur.