Wat is bacterieclassificatie?
Bacterieclassificatie is het proces waarbij soorten bacteriën van elkaar worden onderscheiden en gegroepeerd op basis van gedeelde kenmerken. Een dergelijke classificatie vindt plaats in het kader van het internationaal geaccepteerde systeem van biologische taxonomie, of de wetenschap van het classificeren van organismen. Bij de classificatie van bacteriën wordt met een aantal dingen rekening gehouden, met name RNA-sequenties, maar onder andere ook vorm, biochemie en kenmerken van het externe membraan.
Hoewel er verschillende opvattingen zijn over de manier waarop organismen moeten worden geclassificeerd, verdeelt het huidige heersende systeem al het leven in drie domeinen. Bacteriën vormen een van deze domeinen. Ze vertonen een extreme mate van diversiteit en vormen, wat het aantal betreft, een grote meerderheid van de bekende soorten en zijn, in massa, meer dan alle meercellige organismen op aarde. Bacteriënclassificatie kan moeilijk zijn vanwege een aantal factoren, met name de afwezigheid van complexe structuren gevonden in meer geavanceerde organismen, evenals de neiging van bacteriën om segmenten van DNA over te dragen.
Bacteriologen gebruiken een aantal technieken bij de classificatie van bacteriën. Vorm is de eenvoudigste manier om bacteriën uit elkaar te houden en deze organismen kunnen verschillende vormen vertonen, waaronder staven, spiralen en bollen. Vorm is echter niet noodzakelijkerwijs een exclusief kenmerk en bacteriën die zijn gegroepeerd in sterk verschillende classificaties kunnen vergelijkbare vormen hebben.
Andere morfologische kenmerken, zoals de grootte, kunnen aanzienlijk verschillen van soort tot soort, en typische groepen kunnen ook helpen bij de classificatie. Veel soorten hebben de neiging om groepen individuele cellen te vormen, die sterk in aantal kunnen variëren. De aanwezigheid van externe structuren, zoals kleine tentakelachtige constructies genaamd flagella, kan ook helpen bij het onderscheiden van bacteriesoorten.
Een ander belangrijk hulpmiddel bij de classificatie van bacteriën is een test die bekend staat als de gramkleuringstest, genoemd naar een 19e-eeuwse microbioloog. Deze test kwantificeert bacteriën volgens de dikte van hun buitenmembraan. Gram-negatieve bacteriën hebben een zeer dun membraan en gram-positieve bacteriën hebben een dikker membraan.
Factoren zoals metabolisme en andere biochemische verschillen zijn een ander hulpmiddel voor de classificatie van bacteriën. Bacteriën metaboliseren een grote verscheidenheid van verschillende verbindingen, en de specifieke verbinding of verbindingen die worden gebruikt of omgezet door een specifieke bacterie kunnen helpen bij de identificatie en classificatie ervan. Analyse van andere biochemische gegevens kan ook dit proces helpen.
Vooruitgang in moleculaire analysetechnieken heeft het voor bacteriologen mogelijk gemaakt om bacteriën te differentiëren op basis van verschillen in RNA, evenals specifieke gensequenties. Verdere analyse van de totale hoeveelheid individuele RNA- en DNA-eiwitten en de verhoudingen waarin ze aanwezig zijn, bieden een ander middel voor classificatie. Met behulp van sommige of al deze technieken en waarneembare kenmerken, kunnen bacteriologen bacteriën indelen naar soort en vergelijkbare soorten groeperen.