Co to jest klasyfikacja bakterii?
Klasyfikacja bakterii polega na odróżnianiu rodzajów bakterii od siebie i grupowaniu ich według wspólnych cech. Taka klasyfikacja odbywa się w ramach międzynarodowego systemu taksonomii biologicznej lub nauki o klasyfikowaniu organizmów. Podczas klasyfikacji bakterii bierze się pod uwagę wiele rzeczy, w szczególności sekwencje RNA, w tym między innymi kształt, biochemię i właściwości błony zewnętrznej.
Chociaż istnieją różne poglądy na sposób klasyfikowania organizmów, obecny dominujący system dzieli całe życie na trzy dziedziny. Bakterie tworzą jedną z tych domen. Wykazują one niezwykły stopień różnorodności i liczebnie stanowią znaczną większość znanych gatunków, a ich masa przewyższa liczbę wszystkich organizmów wielokomórkowych na ziemi. Klasyfikacja bakterii może być trudna ze względu na wiele czynników, w szczególności brak złożonych struktur znalezionych w bardziej zaawansowanych organizmach, a także tendencję bakterii do przenoszenia segmentów DNA.
Bakteriolodzy stosują szereg technik klasyfikacji bakterii. Kształt jest najprostszym sposobem odróżnienia bakterii, a organizmy te mogą wykazywać różnorodne kształty, w tym między innymi pręty, spirale i kule. Kształt niekoniecznie jest jednak cechą wyłączną, a bakterie zgrupowane w bardzo różnych klasyfikacjach mogą mieć podobne kształty.
Inne cechy morfologiczne, takie jak rozmiar, mogą się znacznie różnić w zależności od gatunku, a typowe grupy mogą również pomóc w klasyfikacji. Wiele gatunków tworzy grupy pojedynczych komórek, których liczba może się znacznie różnić. Obecność struktur zewnętrznych, takich jak małe macki zwane wici, może również pomóc w odróżnieniu gatunków bakterii.
Innym kluczowym narzędziem w klasyfikacji bakterii jest test znany jako test barwienia metodą gram, nazwany na cześć XIX-wiecznego mikrobiologa. Ten test określa bakterie na podstawie grubości ich zewnętrznej błony. Bakterie Gram-ujemne mają bardzo cienką błonę, a bakterie Gram-dodatnie mają grubszą błonę.
Czynniki takie jak metabolizm i inne biochemiczne różnice są kolejnym narzędziem do klasyfikacji bakterii. Bakterie metabolizują wiele różnych związków, a konkretny związek lub związki stosowane lub przekształcane przez określone bakterie mogą pomóc w jego identyfikacji i klasyfikacji. Analiza innych danych biochemicznych może również pomóc w tym procesie.
Postępy w technikach analizy molekularnej umożliwiły bakteriologom różnicowanie bakterii w zależności od różnic w RNA, a także określonych sekwencji genów. Dalsza analiza całkowitej ilości poszczególnych białek RNA i DNA oraz proporcji, w których są one obecne, zapewnia kolejny sposób klasyfikacji. Stosując niektóre lub wszystkie z tych technik i obserwowalne cechy, bakteriologowie są w stanie klasyfikować bakterie według gatunków i grupować podobne gatunki razem.