Hva bør jeg vite om bakteriell identifikasjon?

Bakteriell identifikasjon er en prosess som brukes til å kartlegge identiteten til spesifikke bakterier. Det er en viktig del av medisinsk behandling, siden mange behandlinger er sterkt avhengig av identiteten til den bestemte organismen som forårsaker et medisinsk problem, og det er også en viktig del av vitenskapelig forskning. En rekke teknikker brukes i bakterieidentifikasjon, og nye teknikker blir stadig utviklet når folk lærer mer om bakterier og nytt medisinsk utstyr utvikles.

Det første stadiet i bakterieidentifikasjon innebærer å lage et isolat, en fungerende prøve av de aktuelle bakteriene. Isolater starter med en liten vattpinne av de mistenkte bakteriene hentet fra en pasient eller en gjenstand. Isolatet skapes ved å finne et vekstmedium som vil støtte bakteriene, og med suksess dyrke nok av bakteriene til studie. Dette kan være en virkelig utfordring, siden bakterier er veldig kresen, og de vil ikke vokse i bare noe medium. Det er også viktig å unngå å forurense vekstmediet eller prøven, da dette kan føre til forvirrende resultater.

Når en bakterie er blitt dyrket, kan et bredt utvalg verktøy brukes til å gi ledetråder til identiteten. En av de mest basale er en Gram-flekker, som deler bakterier i Gram-positive og Gram-negative bakterier ved bruk av en kjemisk flekk. Andre flekker kan brukes til å øke kontrasten, noe som gjør bakteriene lettere å se under et mikroskop. Visuell identifikasjon under mikroskop kan ofte oppnås med kjente bakteriearter, spesielt de med en særegen form.

Det er flere verktøy i arsenal av bakterieidentifikasjon. En forsker kan bruke serologiske metoder, som involverer å eksponere en prøve av ukjente bakterier for forskjellige antistoffer for å se om det er en reaksjon, eller gensekvensering, der en genetisk kode for en bakterie avdekkes. Gensekvensering kan også brukes til å skille mellom to nært beslektede bakteriestammer, og gi informasjon om hvorfor en stamme reagerer på et bestemt medisineringskurs mens en annen ikke gjør det. Respons på forskjellige kjemikalier og stimuli som ultrafiolett stråling kan også studeres.

Bakteriell identifikasjon utføres klassisk i et laboratorium, siden laboratorier har medisinsk utstyr, kjemikalier og verktøy som kan brukes i løpet av å spore identiteten til en bakterie. Noen laboratorier spesialiserer seg på å dyrke og identifisere prøver fra sykehus og medisinske klinikker, mens andre fokuserer på forskning, og identifiserer prøver av nye og ukjente bakterier slik at de kan klassifiseres. Laboratoriemiljøet er tett kontrollert for å forhindre forurensning og utilsiktet infeksjon av labarbeidere, med spesielt virulente organismer som blir studert i høysikkerhetslaboratorier som inkluderer flere lag med beskyttelse for forskerne.