Co bych měl vědět o bakteriální identifikaci?
Bakteriální identifikace je proces, který se používá k určení identity konkrétních bakterií. Je to důležitá součást lékařského ošetření, protože mnoho ošetření je silně závislé na identitě konkrétního organismu, který způsobuje zdravotní problém, a je také důležitou součástí vědeckého výzkumu. Při identifikaci bakterií se používá řada technik a neustále se vyvíjejí nové techniky, protože lidé se dozví více o bakteriích a vyvíjí se nové lékařské vybavení.
První etapa bakteriální identifikace zahrnuje vytvoření izolátu, pracovního vzorku dotyčných bakterií. Izoláty začínají malým výtěrem podezřelých bakterií odebraných pacientovi nebo předmětu. Izolát je vytvořen nalezením růstového média, které bude podporovat bakterie, a úspěšným kultivováním dostatečného množství bakterií pro studium. To může být skutečná výzva, protože bakterie jsou velmi vybíravé a nebudou růst pouze v žádném médiu. Je také důležité zabránit kontaminaci růstového média nebo vzorku, protože to může vést k matoucím výsledkům.
Jakmile je bakterie kultivována, lze použít celou řadu nástrojů k poskytnutí vodítek k její identitě. Jednou z nejzákladnějších je Gramovo barvení, které pomocí chemického barviva dělí bakterie na Gram-pozitivní a Gram-negativní bakterie. Další skvrny mohou být použity ke zvýšení kontrastu, čímž se bakterie lépe vidí pod mikroskopem. Vizuální identifikace pod mikroskopem může být běžně prováděna se známými bakteriálními druhy, zejména těmi, které mají výrazný tvar.
V arzenálu bakteriální identifikace je více nástrojů. Výzkumník může použít sérologické metody, které zahrnují vystavení vzorku neznámých bakterií různým protilátkám, aby zjistily, zda se jedná o reakci nebo genové sekvenování, při kterém je genetický kód bakterie rozpadlý. Genové sekvenování lze také použít k rozlišení mezi dvěma blízce příbuznými kmeny bakterií, čímž se poskytne informace o tom, proč jeden kmen reaguje na určitý průběh léčení, zatímco jiný ne. Lze také studovat reakce na různé chemikálie a podněty, jako je ultrafialové záření.
Bakteriální identifikace se klasicky provádí v laboratoři, protože laboratoře mají lékařské vybavení, chemikálie a nástroje, které lze použít při sledování identity bakterie. Některé laboratoře se specializují na kultivaci a identifikaci vzorků z nemocnic a lékařských klinik, zatímco jiné se zaměřují na výzkum, identifikaci vzorků nových a neznámých bakterií, aby mohly být klasifikovány. Laboratorní prostředí je přísně kontrolováno, aby se zabránilo kontaminaci a náhodné infekci laboratorních pracovníků, se zvláště virulentními organismy studovanými ve vysoce bezpečnostních laboratořích, které zahrnují několik vrstev ochrany vědců.