Co powinienem wiedzieć o identyfikacji bakteryjnej?
Identyfikacja bakterii jest procesem stosowanym do ustalenia tożsamości konkretnych bakterii. Jest to ważna część leczenia, ponieważ wiele zabiegów jest silnie uzależnionych od tożsamości konkretnego organizmu powodującego problem medyczny, a także jest ważną częścią badań naukowych. W identyfikacji bakterii stosuje się wiele technik, a nowe są ciągle opracowywane, gdy ludzie dowiadują się więcej o bakteriach i opracowywany jest nowy sprzęt medyczny.
Pierwszy etap identyfikacji bakteryjnej obejmuje stworzenie izolatu, roboczej próbki danych bakterii. Izolaty zaczynają się od małego wymazu z podejrzanych bakterii pobranego od pacjenta lub obiektu. Izolat jest tworzony przez znalezienie pożywki wzrostowej, która będzie wspierać bakterie i z powodzeniem hodując wystarczającą liczbę bakterii do badań. Może to być prawdziwe wyzwanie, ponieważ bakterie są bardzo wybredne i nie będą rosły na żadnym podłożu. Ważne jest również, aby unikać zanieczyszczenia podłoża wzrostowego lub próbki, ponieważ może to powodować mylące wyniki.
Po wyhodowaniu bakterii można użyć szerokiej gamy narzędzi, aby zapewnić wskazówki na temat jej tożsamości. Jednym z najbardziej podstawowych jest barwienie metodą Grama, które dzieli bakterie na bakterie Gram-dodatnie i Gram-ujemne za pomocą chemicznego zabarwienia. Inne plamy można zastosować w celu zwiększenia kontrastu, dzięki czemu bakterie są lepiej widoczne pod mikroskopem. Identyfikację wizualną pod mikroskopem można zwykle przeprowadzić ze znanymi gatunkami bakteryjnymi, zwłaszcza tymi o charakterystycznym kształcie.
W arsenale identyfikacji bakteryjnej jest więcej narzędzi. Badacz może zastosować metody serologiczne, które polegają na wystawieniu próbki nieznanych bakterii na działanie różnych przeciwciał, aby sprawdzić, czy zachodzi reakcja lub sekwencjonowanie genów, w których kod genetyczny bakterii jest wyjaśniony. Sekwencjonowanie genów można również wykorzystać do rozróżnienia między dwoma blisko spokrewnionymi szczepami bakterii, dostarczając informacji o tym, dlaczego jeden szczep reaguje na określony cykl leczenia, a inny nie. Można również badać odpowiedzi na różne chemikalia i bodźce, takie jak promieniowanie ultrafioletowe.
Identyfikacja bakterii jest klasycznie przeprowadzana w laboratorium, ponieważ laboratoria dysponują sprzętem medycznym, chemikaliami i narzędziami, których można użyć do śledzenia tożsamości bakterii. Niektóre laboratoria specjalizują się w hodowli i identyfikacji próbek ze szpitali i klinik medycznych, podczas gdy inne koncentrują się na badaniach, identyfikując próbki nowych i nieznanych bakterii, aby można je było sklasyfikować. Środowisko laboratoryjne jest ściśle kontrolowane, aby zapobiec zanieczyszczeniu i przypadkowemu zakażeniu pracowników laboratoryjnych, a szczególnie zjadliwe organizmy badane są w laboratoriach o wysokim poziomie bezpieczeństwa, które obejmują kilka warstw ochrony dla naukowców.