Hva er prokaryotisk transkripsjon?

I motsetning til eukaryote celler, har en prokaryotisk celle som en bakterie generelt ikke individuelle strukturer som kalles organeller i seg. Det er vanligvis ingen kjerner, mitokondrier eller andre områder der separate metabolske prosesser oppstår; alt er stort sett frittflytende innenfor celleveggen og plasmamembranen. I likhet med eukaryote celler er det vanligvis deler av deoksyribonukleinsyre (DNA) så vel som ribonukleinsyre (RNA) som kan kopieres gjennom transkripsjon. Prokaryotisk transkripsjon er typisk kontrollert av et enzym kalt prokaryotisk RNA-polymerase, som må starte transkripsjonen av DNA, mens avslutning av prosessen vanligvis utløses av andre sekvenser av nukleotider.

Når RNA-polymerase-enzymet beveger lengden på en DNA-streng, utbretter det det på transkripsjonsstedet, og det kan gjøres messenger, transfer og ribosomalt RNA. Det er typisk to typer enzym i prokaryot transkripsjon; det ene er et kjerneenzym som kan lage kopier, men ikke klarer å finne det aktuelle stedet på et gen. En holoenzymform av molekylet er ofte i stand til å initiere transkripsjon i den spesifikke regionen, og er derfor designet for å lokalisere promotorsekvensene som forteller molekylet når de skal begynne å kopiere DNA. Holoenzymet utfører denne funksjonen via en komponent som kalles en sigma.

Prokaryot transkripsjon begynner når RNA-polymerasen festes til DNA-promoterstedet. Molekylet og den dobbeltstrengede strukturen, kalt et lukket kompleks, kan deretter samvirke og DNA åpnes i en enkeltstrenget sekvens nær der transkripsjonen startes. Dette kalles et åpent kompleks. Enzymet starter typisk transkripsjonsprosessen ved å lage rundt 10 ubrukelige avskrifter, som er blokkert fra å forlate komplekset av et protein.

Når dette proteinet er frigjort, fortsetter enzymet med transkripsjon. Noen ganger er det forskjeller i hvor sterkt RNA-polymerasen og proteiner binder seg til DNA; styrken til denne bindingen kan relateres til den statistiske sannsynligheten for at en viss base vil være på et gitt sted. Hvor tett basene samsvarer med denne konsensussekvensen avgjør ofte hvor sterk båndet vil være.

Prokaryot transkripsjon av RNA skjer vanligvis ved omtrent 40 nukleotider hvert sekund. Noen proteiner kan endre hastigheten som dette skjer, og hastigheten på å kopiere bestemte sekvenser kan også være forskjellig. Regulatorgener endrer ofte hvordan sekvenser uttrykkes avhengig av hva cellen trenger. Prokaryot transkripsjon kan avsluttes enten når sekvenser i RNA får molekylkomplekset og DNA til å skilles, eller når et spesifikt protein binder seg til og reiser opp til RNA-polymerase-enzymet.