Hvad er prokaryot transkription?

I modsætning til eukaryote celler har en prokaryot celle, såsom en bakterie, generelt ikke individuelle strukturer, der kaldes organeller i sig. Der er typisk ingen kerner, mitokondrier eller andre områder, hvor separate metaboliske processer forekommer; alt er for det meste fritflydende inde i cellevæggen og plasmamembranen. Ligesom eukaryote celler er der normalt strenge af deoxyribonukleinsyre (DNA) såvel som ribonukleinsyre (RNA), som kan kopieres gennem transkription. Prokaryot transkription kontrolleres typisk af et enzym kaldet prokaryot RNA-polymerase, som skal indlede transkription af DNA, mens afslutning af processen normalt udløses af andre sekvenser af nukleotider.

Når RNA-polymerase-enzymet bevæger sig langs en DNA-streng, udruller det det på transkriptionsstedet, og der kan foretages messenger, transfer og ribosomalt RNA. Der er typisk to typer af enzymet ved prokaryot transkription; det ene er et kerneenzym, der kan fremstille kopier, men ikke kan finde det passende sted på et gen. En holoenzymform af molekylet er ofte i stand til at initiere transkription i det specifikke område, og er derfor designet til at lokalisere promotorsekvenserne, der fortæller molekylet, hvornår man skal begynde at kopiere DNA'et. Holoenzymet udfører denne funktion via en komponent, der kaldes en sigma.

Prokaryot transkription begynder, når RNA-polymerasen bindes til DNA-promotorstedet. Molekylet og den dobbeltstrengede struktur, kaldet et lukket kompleks, kan derefter interagere, og DNA'et åbnes i en enkeltstrenget sekvens nær hvor transkription startes. Dette kaldes et åbent kompleks. Enzymet starter typisk transkriptionsprocessen ved at skabe omkring 10 ubrugelige transkripter, som er blokeret fra at forlade komplekset af et protein.

Når dette protein er frigivet, fortsætter enzymet med transkription. Der er undertiden forskelle i, hvor stærkt RNA-polymerasen og proteinerne binder til DNA; styrken af ​​denne binding kan relateres til den statistiske sandsynlighed for, at en bestemt base vil være på et givet sted. Hvor tæt baserne matcher denne konsensus-sekvens afgør ofte, hvor stærk båndet vil være.

Prokaryot transkription af RNA forekommer sædvanligvis ved ca. 40 nukleotider hvert sekund. Nogle proteiner kan ændre hastigheden, hvormed dette sker, og hastigheden for at kopiere bestemte sekvenser kan også være anderledes. Regulatorgener ændrer ofte, hvordan sekvenser udtrykkes afhængigt af, hvad cellen har brug for. Prokaryot transkription kan afsluttes enten når sekvenser i RNA får det molekylære kompleks og DNA til at adskilles, eller når et specifikt protein binder til og rejser op til RNA-polymerase-enzymet.