Vad är prokaryot transkription?

Till skillnad från eukaryota celler har en prokaryot cell som en bakterie i allmänhet inte enskilda strukturer som kallas organeller i sig. Det finns vanligtvis ingen kärna, mitokondrier eller andra områden där separata metaboliska processer inträffar; allt är främst fritt flytande inuti cellväggen och plasmamembranet. Liksom eukaryota celler finns det vanligtvis delar av deoxiribonukleinsyra (DNA) såväl som ribonukleinsyra (RNA) som kan kopieras genom transkription. Prokaryot transkription kontrolleras vanligtvis av ett enzym som kallas prokaryot RNA-polymeras, som måste initiera transkription av DNA, medan avslutande av processen vanligtvis triggas av andra sekvenser av nukleotider.

När RNA-polymerasenzymet rör sig längden på en DNA-sträng, rivnar det upp på transkriptionsstället och budbärare, överföring och ribosomalt RNA kan göras. Det finns vanligtvis två typer av enzymet i prokaryot transkription; ett är ett kärnenzym som kan göra kopior men inte kan hitta rätt plats på en gen. En holoenzymform av molekylen kan ofta initiera transkription i den specifika regionen och är därför utformad för att lokalisera promotorsekvenserna som berättar molekylen när man börjar kopiera DNA. Holoenzymet utför denna funktion via en komponent som kallas sigma.

Prokaryot transkription börjar när RNA-polymeraset fästs vid DNA-promotorstället. Molekylen och den dubbelsträngade strukturen, kallad ett slutet komplex, kan sedan interagera och DNA öppnas i en enkelsträngad sekvens nära där transkription startas. Detta kallas ett öppet komplex. Enzymet börjar typiskt transkriptionsprocessen genom att skapa cirka 10 oanvändbara transkript, som är blockerade från att lämna komplexet av ett protein.

När detta protein släpps fortsätter enzymet med transkription. Det finns ibland skillnader i hur starkt RNA-polymeras och proteiner binder till DNA; styrkan hos denna bindning kan relateras till den statistiska sannolikheten att en viss bas kommer att vara på en given plats. Hur nära baserna matchar denna konsensussekvens avgör ofta hur stark bindningen kommer att vara.

Prokaryot transkription av RNA sker vanligtvis vid cirka 40 nukleotider varje sekund. Vissa proteiner kan ändra hastigheten med detta och hastigheten för att kopiera vissa sekvenser kan också vara annorlunda. Regulatorgener ändrar ofta hur sekvenser uttrycks beroende på vad cellen behöver. Prokaryot transkription kan avslutas antingen när sekvenser i RNA orsakar att molekylkomplexet och DNA separeras, eller när ett specifikt protein binder till och reser upp till RNA-polymeras-enzymet.