Co je prokaryotická transkripce?

Na rozdíl od eukaryotických buněk prokaryotická buňka, jako je bakterie, v ní obecně nemá jednotlivé struktury zvané organely. Obvykle neexistuje žádné jádro, mitochondrie nebo jiné oblasti, kde dochází k samostatným metabolickým procesům; Všechno je většinou volně plovoucí uvnitř buněčné stěny a plazmatické membrány. Stejně jako eukaryotické buňky jsou obvykle i existují prameny kyseliny deoxyribonukleové (DNA) a kyseliny ribonukleové (RNA), které lze zkopírovat transkripcí. Prokaryotická transkripce je obvykle řízena enzymem zvaným prokaryotická RNA polymeráza, která musí iniciovat transkripci DNA, zatímco ukončení procesu je obvykle spouštěno jinými sekvencemi nukleotidů.

Když Enzym RNA polymerázy cestuje po délce řetězce DNA, může být provedeno v transkripčním místě a messengeru, přenosu a ribozomální RNA. Obvykle existují dva typy enzymu v prokaryotické transkripci; Jeden je základní enzym, který dokáže vytvářet kopieale není schopen najít příslušný web na genu. Holoenzymová forma molekuly je často schopna iniciovat transkripci ve specifické oblasti, a proto je navržena tak, aby lokalizovala promotorové sekvence, které sdělují molekule, kdy začít kopírovat DNA. Holoenzym provádí tuto funkci prostřednictvím komponenty zvané sigma.

Prokaryotická transkripce začíná, když se RNA polymeráza spojuje k místu promotoru DNA. Molekula a dvouřetězcová struktura, nazývaná uzavřená komplex, pak mohou interagovat a DNA je otevřena do jednovláknové sekvence poblíž místa, kde je spuštěna transkripce. Tomu se říká otevřený komplex. Enzym obvykle začíná transkripční proces vytvořením přibližně 10 nepoužitelných transkriptů, které jsou blokovány z opuštění komplexu proteinem.

Jakmile je tento protein uvolněn, pak enzym pokračuje transkripcí. Někdy se lišíPronásledování v tom, jak silně se RNA polymeráza a proteiny vážou na DNA; Síla tohoto vazby může souviset se statistickou pravděpodobností, že určitá základna bude na daném místě. Jak úzce se základny shodují s touto konsensuální sekvencí často určuje, jak silná bude vazba.

Prokaryotická transkripce RNA se obvykle vyskytuje při přibližně 40 nukleotidech každou sekundu. Některé proteiny mohou změnit rychlost, jakou k tomu dochází, a rychlost kopírování určitých sekvencí se může také lišit. Geny regulátoru často mění, jak jsou sekvence exprimovány v závislosti na tom, co buňka potřebuje. Prokaryotická transkripce může být ukončena buď, když sekvence v RNA způsobí, že se molekulární komplex a DNA oddělí, nebo když se specifický protein váže na enzym RNA polymerázy.