Vad är ett stoppkodon?
En stoppkodon är en nukleinsyratriplett i messenger-RNA (mRNA) som inte kodar för en aminosyra och därmed stoppar produktionen av ett protein. I huvudsak berättar stoppkodonet till ribosomerna som utför mRNA-koden att det är dags att stoppa; man kunde tänka på det nästan som en perforerad linje i ett pappersark som indikerar "rivning här." Utan ett stoppkodon på plats skulle proteiner tillverkade av RNA bestå av ändlösa kedjor av aminosyror, eftersom ribosomerna inte skulle veta när de skulle stoppa .
Stoppkodoner finns också i DNA, så att de överförs när DNA transkriberas till RNA. I DNA är de tre stoppkodonerna TAA, TAG och TGA. Dessa tripletter är "nonsens" kodoner som inte kodar för någonting, vilket minskar risken för att ett misstag kommer att göras. När de transkriberas till RNA är stoppkodonerna UAA, UAG och UGA.
Längden på en aminosyrakedja i ett protein kan variera, vilket innebär att stoppkodoner hittas med varierande intervall i kodning av DNA och RNA, områdena i den genetiska koden som innehåller information som måste utföras för att göra proteiner. Stoppkodoner kan identifieras när DNA sekvenseras och kan användas för att identifiera de specifika placeringarna i den genetiska koden som motsvarar specifika proteiner, och därmed till särskild genetisk information.
Som med andra DNA-områden är det möjligt för en mutation att visas i ett stoppkodon. Kodonet kan transkriberas felaktigt, eller nukleinsyror i kodonet kan bytas ut, vilket orsakar problem när ribosomerna går att översätta mRNA för att bygga aminosyrakedjor. I en enda cell kan detta resultera i en slumpmässig mutation som gör att cellen dör eller fungerar inte. Om fel emellertid uppstår i stoppkodonerna i en groddcell, och att groddcellen förenas med en från en annan organisme, kommer den resulterande organismen att ha en medfödd mutation, och i vissa fall kan mutationen vara så allvarlig att organismen inte kan leva .
Genetiker kan använda sina kunskaper om stoppkodoner för att sortera informationen i en bit av DNA eller RNA. Genom att leta efter stoppkodoner kan de identifiera specifika kedjor av aminosyror och bestämma vilka proteiner det genetiska materialet kodar för. Denna information kan användas för att lära sig mer om vad den gör och vad som händer när det går fel. Att hitta ett stoppkodon kan vara användbart när man studerar DNA och RNA för att lära sig mer om en mutation eller variation som har identifierats.