Hvad er et stop-kodon?
Et stopkodon er en nukleinsyretriplet i messenger-RNA (mRNA), som ikke koder for en aminosyre, hvorved produktionen af et protein stoppes. I det væsentlige fortæller stopkodonet ribosomer, der udfører mRNA-koden, at det er tid til at stoppe; man kunne tænke på det næsten som en perforeret linje i et papirark, der indikerer "rive her." Uden et stopkodon på plads, ville proteiner fremstillet af RNA bestå af utallige aminosyrekæder, fordi ribosomerne ikke vidste, hvornår de skulle stoppe .
Stopkodoner er også til stede i DNA, så de overføres, når DNA transkriberes til RNA. I DNA er de tre stopkodoner TAA, TAG og TGA. Disse tripletter er "nonsense" -kodoner, der ikke koder for noget, hvilket reducerer risikoen for, at der vil blive begået en fejl. Når de transkriberes til RNA, er stopkodonerne UAA, UAG og UGA.
Længden af en aminosyrekæde i et protein kan variere, hvilket betyder, at der findes stopkodoner med forskellige intervaller i kodning af DNA og RNA, områderne i den genetiske kode, der indeholder information, der skal udføres for at fremstille proteiner. Stopkodoner kan identificeres, når DNA sekventeres, og kan bruges til at identificere de specifikke placeringer i den genetiske kode, der svarer til bestemte proteiner og derved til særlig genetisk information.
Som med andre DNA-områder er det muligt for en mutation at optræde i et stopkodon. Kodonet kan transkriberes forkert, eller nukleinsyrer i kodonet kan udskiftes, hvilket forårsager problemer, når ribosomer går til at oversætte mRNA til at bygge aminosyrekæder. I en enkelt celle kan dette resultere i en tilfældig mutation, der får cellen til at dø eller fungere. Hvis der dog forekommer fejl i stopkodonerne i en kimcelle, og at kimcellen forbindes med en fra en anden organisme, vil den resulterende organisme have en medfødt mutation, og i nogle tilfælde kan mutationen være så alvorlig, at organismen ikke kan leve .
Genetikere kan bruge deres viden om stopkodoner til at sortere informationen i en del af DNA eller RNA. Ved at lede efter stopkodoner kan de identificere specifikke aminosyrekæder og bestemme, hvilke proteiner det genetiske materiale koder for. Disse oplysninger kan bruges til at lære mere om, hvad de gør, og hvad der sker, når det går galt. At finde et stopkodon kan være nyttigt, når man studerer DNA og RNA for at lære mere om en mutation eller variation, der er identificeret.