Co je celková RNA?
Kyselina ribonukleová (RNA) je polymer zapojený do syntézy proteinů, genové replikace a replikace deoxyribonukleové kyseliny (DNA). Polymer je molekula vyrobená z lineárních řetězců, takže RNA je lineární řetězec vyrobený z ribonukleotidů. Každá molekula ribonukleotidu se skládá z dusíkové báze s fosfátovou skupinou a ribózy. Celková RNA označuje RNA, která byla extrahována nebo izolována z buněk nebo tkáně za účelem genetického mapování. Tento typ kompletní RNA lze izolovat z organismů jednotlivých buněk, živočišných tkání, rostlinných tkání, kvasinek a hub
Celková RNA je extrahována z buněk a tkání během procesu zvaného izolace RNA. Rozrušení buněk je prvním a nejdůležitějším krokem v tomto procesu a buňky mohou být narušeny mechanickými prostředky, jako je homogenizace nebo přidáním enzymů. Enzymy chemicky odbourávají povlak nebo kapsli buňky, takže lze izolovat celkovou RNA. Během izolace celkové RNA se z RNA odstraní lipidy, proteiny a DNA, takže zůstane ve své nejčistší formě.
Mezi RNA a DNA existuje celá řada rozdílů, i když oba nukleotidy se spojují dohromady a vytvářejí řetězce. RNA je jednořetězcový polymer, zatímco DNA je dvouvláknová. DNA navíc obsahuje deoxyribózu, zatímco RNA obsahuje pouze ribózu.
Ačkoli nejzákladnější struktura RNA je řetězec, RNA může mít sekundární a terciární strukturu. Sekundární struktury jsou často spirálové a zahrnují vlásenky, smyčky a tvary podobné uzlům. Terciární struktury jsou nejsložitější a vyskytují se, když vzdálené nukleotidy vzájemně interagují. Vědci používají tyto struktury k pochopení a určení funkcí různých molekul RNA.
Jakmile je molekula RNA syntetizována během transkripce, musí se podrobit zpracování, než bude připravena vykonávat zamýšlenou funkci. Zpracování zahrnuje změnu segmentů nebo řetězců specifických nukleotidů. Molekuly RNA s různými funkcemi mají různé názvy. Například messengerová RNA (mRNA) je pojmenována, protože je zodpovědná za přenos genetického kódu z DNA na ribozomy použité během syntézy proteinu.
Syntéza proteinu, která je vědecky označována jako translace, vyžaduje kromě mRNA dva další typy RNA. Translační RNA nebo tRNA molekuly přizpůsobují nukleotidy v mRNA aminokyselinám během translace. Molekula RNA, která je zodpovědná za spojení ribosomů s rostoucími proteinovými řetězci, se nazývá rRNA. Tři hlavní typy RNA musí být přítomny pro více funkcí RNA. Navíc většina z méně běžných typů RNA hraje roli v translaci prováděním základních funkcí v jádru a cytoplazmě.