Hvad er total RNA?
Ribonukleinsyre (RNA) er en polymer involveret i proteinsyntese, genreplikation og deoxyribonukleinsyre (DNA) replikation. En polymer er et molekyle fremstillet af lineære kæder, så RNA er en lineær kæde fremstillet af ribonukleotider. Hvert ribonukleotidmolekyle består af en nitrogenbase med en phosphatgruppe og ribose. Total RNA henviser til RNA, der ekstraheres eller isoleres fra celler eller væv med henblik på genetisk kortlægning. Denne type komplet RNA kan isoleres fra enkeltcelleorganismer, dyrevæv, plantevæv, gær og svamp
Total RNA ekstraheres fra celler og væv under en proces kaldet RNA-isolering. Celleforstyrrelse er det første og vigtigste trin i denne proces, og cellerne kan forstyrres ved hjælp af mekaniske midler, såsom homogenisering, eller gennem tilsætning af enzymer. Enzymer nedbryder kemisk belægningen eller kapslen i en celle, så det totale RNA kan isoleres. Under isoleringen af total RNA fjernes lipider, proteiner og DNA fra RNA, så det efterlades i sin reneste form.
Der er en række forskelle mellem RNA og DNA, skønt de to nukleotider kobles sammen for at danne kæder. RNA er en enkeltkædet polymer, medens DNA er dobbeltstrenget. Derudover indeholder DNA deoxyribose, mens RNA kun indeholder ribose.
Selvom den mest basale struktur af RNA er en kæde, kan RNA have sekundære og tertiære strukturer. Sekundære strukturer er ofte spiralformede og inkluderer hårnåle, løkker og knude-lignende former. Tertiære strukturer er de mest komplekse og forekommer, når fjerne nukleotider interagerer med hinanden. Forskere bruger disse strukturer til at forstå og bestemme funktionerne af forskellige RNA-molekyler.
Når et RNA-molekyle er syntetiseret under transkription, skal det gennemgå behandling før det er klar til at udføre sin tilsigtede funktion. Bearbejdning involverer ændring af segmenter eller strenge af specifikke nukleotider. RNA-molekyler med forskellige funktioner har forskellige navne. For eksempel er messenger RNA (mRNA) navngivet, fordi det er ansvarligt for at overføre den genetiske kode fra DNA til ribosomer brugt under proteinsyntese.
Proteinsyntese, der videnskabeligt betegnes som translation, kræver yderligere to typer RNA ud over mRNA. Oversættelse RNA eller tRNA molekyler tilpasser nukleotider inden i mRNA til aminosyrer under translation. RNA-molekylet, der er ansvarlig for at binde ribosomer til voksende proteinkæder kaldes rRNA. De tre hovedtyper af RNA kræves at være til stede for flere RNA-funktioner. Derudover spiller de fleste af de mindre almindelige typer af RNA en rolle i translation ved at udføre essentielle funktioner i kernen og cytoplasma.