En biología, ¿qué es una secuencia de consenso?
Una secuencia de consenso es un conjunto de proteínas, o nucleótidos en ácido desoxirribonucleico (ADN), que aparece regularmente. Los aminoácidos adenina, guanina, citosina y timina forman secuencias genéticas en el ADN. Los biólogos moleculares a menudo usan estadísticas para predecir dónde estará una determinada secuencia de ellos o para comprender dónde tienden a unirse moléculas particulares. Donde las secuencias de aminoácidos permanecen iguales y donde tienden a variar pueden representarse mediante una fórmula. En el caso de una secuencia promotora de consenso, un tipo particular de enzima puede unirse a sitios de proteínas secuenciadas de manera similar.
Los genetistas, como los investigadores en muchas disciplinas científicas, a menudo usan sustituciones para simplificar sistemas complejos. Hay tantas bases de aminoácidos y genes en el cuerpo que los científicos no pueden contarlos a menos que haya algún sistema general para hacerlo. Una secuencia de consenso puede aparecer en muchos lugares del ADN, así como en varios seres vivos. Las similitudes y diferencias que tienden a ocurrir pueden indicarse mediante una fórmula.
Estadísticamente, los científicos pueden clasificar las secuencias genéticas para buscar patrones. Los patrones repetitivos, llamados motivos de secuencia, generalmente se usan para representar áreas genéticas que controlan procesos biológicos específicos. Las secuencias de consenso también pueden ofrecer información sobre cómo se sintetizan las proteínas o cómo se guían las moléculas dentro de una célula.
En la notación de una secuencia de consenso, la ubicación de algunos nucleótidos puede mostrar que siempre están en la ubicación representada. También se puede indicar que un nucleótido u otro puede estar allí. En este caso, generalmente no se indica con qué frecuencia aparece un aminoácido, en lugar de otro. Algunas veces se usa un modelo gráfico para indicar esta frecuencia, aumentando o disminuyendo el tamaño de los símbolos. Algunos programas de software pueden generar logotipos de secuencia automáticamente.
A menudo, una secuencia de consenso coincide con un sitio de unión a proteínas reconocido. Para representar con precisión las secuencias en el genoma, a menudo se utilizan fórmulas matemáticas. Estos incluyen fórmulas estadísticas como logaritmos y valores numéricos, que pueden ser positivos o negativos, para representar la ubicación de la información genética. Los procesos en el genoma para las funciones biológicas normales, así como los relacionados con enfermedades, se pueden analizar de esta manera.
Las representaciones matemáticas de una secuencia de consenso generalmente proporcionan un modelo de patrones de ADN y aminoácidos. Por lo general, no se proporciona una imagen exacta. Sin embargo, las secuencias pueden ayudar a los científicos a relacionar los aspectos funcionales de diferentes partes del genoma con los patrones evolutivos de los organismos.