Em biologia, o que é uma sequência de consenso?

Uma sequência de consenso é um conjunto de proteínas ou nucleotídeos no ácido desoxirribonucleico (DNA), que aparece regularmente. Os aminoácidos adenina, guanina, citosina e timina formam sequências genéticas no DNA. Os biólogos moleculares costumam usar estatísticas para prever onde uma determinada sequência delas estará, ou para entender onde determinadas moléculas tendem a se ligar. Onde as seqüências de aminoácidos permanecem as mesmas e onde elas tendem a variar podem ser representadas por uma fórmula. No caso de uma sequência promotora de consenso, um tipo particular de enzima pode se ligar a locais de proteínas seqüenciadas da mesma forma.

Os geneticistas, como pesquisadores de muitas disciplinas científicas, costumam usar substituições para simplificar sistemas complexos. Existem tantas bases e genes de aminoácidos no corpo que os cientistas não podem contá-los, a menos que haja algum sistema geral para isso. Uma sequência de consenso pode aparecer em muitos locais no DNA, bem como em vários seres vivos. As semelhanças e diferenças que tendem a ocorrer podem ser indicadas por uma fórmula.

Estatisticamente, os cientistas podem classificar sequências genéticas para procurar padrões. Padrões repetidos, chamados motivos de sequência, são geralmente usados ​​para representar áreas genéticas que controlam processos biológicos específicos. Sequências de consenso também podem oferecer informações sobre como as proteínas são sintetizadas ou como as moléculas são guiadas dentro de uma célula.

Na notação de uma sequência de consenso, a localização de alguns nucleotídeos pode mostrar que eles estão sempre na localização representada. Também pode ser indicado que um nucleotídeo ou outro pode estar lá. Nesse caso, a frequência com que um aminoácido aparece, em vez de outro, geralmente não é declarada. Às vezes, um modelo gráfico é usado para indicar essa frequência, aumentando ou diminuindo o tamanho dos símbolos. Alguns programas de software podem gerar logotipos de sequência automaticamente.

Frequentemente, uma sequência de consenso corresponde a um local de ligação à proteína reconhecido. Para representar com precisão sequências no genoma, são frequentemente usadas fórmulas matemáticas. Isso inclui fórmulas estatísticas, como logaritmos e valores numéricos, que podem ser positivos ou negativos, para representar a localização da informação genética. Os processos no genoma para funções biológicas normais, bem como os relacionados a doenças, podem ser analisados ​​dessa maneira.

As representações matemáticas de uma sequência de consenso geralmente fornecem um modelo de padrões de DNA e aminoácidos. Uma imagem exata normalmente não é fornecida. As seqüências, no entanto, podem ajudar os cientistas a relacionar os aspectos funcionais de diferentes partes do genoma aos padrões evolutivos dos organismos.