En biologie, qu'est-ce qu'une séquence consensuelle?

Une séquence consensuelle est un ensemble de protéines, ou nucléotides dans l'acide désoxyribonucléique (ADN), qui apparaît régulièrement.Les acides aminés adénine, guanine, cytosine et thymine constituent des séquences génétiques dans l'ADN.Les biologistes moléculaires utilisent souvent des statistiques pour prédire où se trouvent une certaine séquence, ou pour comprendre où des molécules particulières ont tendance à se lier.Où les séquences d'acides aminés restent les mêmes et où elles ont tendance à varier peuvent être représentées par une formule.Dans le cas d'une séquence de promoteur de consensus, un type particulier d'enzyme peut se lier à des sites de protéines séquencées similaires.

Les généticiens, comme les chercheurs dans de nombreuses disciplines scientifiques, utilisent souvent des substitutions pour simplifier les systèmes complexes.Il y a tellement de bases et de gènes d'acides aminés dans le corps que les scientifiques ne peuvent pas les compter, sauf s'il existe un système général pour le faire.Une séquence consensuelle peut apparaître dans de nombreux endroits de l'ADN ainsi que dans divers êtres vivants.Les similitudes et les différences qui ont tendance à se produire peuvent être indiquées par une formule.

Statistiquement, les scientifiques peuvent classer les séquences génétiques pour rechercher des modèles.Les modèles répétés, appelés motifs de séquence, sont généralement utilisés pour représenter les domaines génétiques qui contrôlent des processus biologiques spécifiques.Les séquences de consensus peuvent également offrir un aperçu de la façon dont les protéines sont synthétisées ou de la façon dont les molécules sont guidées dans une cellule.

Dans la notation d'une séquence de consensus, l'emplacement de certains nucléotides peut montrer qu'ils sont toujours à l'emplacement représenté.On peut également indiquer qu'un nucléotide ou un autre peut être là.Dans ce cas, la fréquence à laquelle un acide aminé apparaît, à la place d'un autre, n'est généralement pas énoncé.Un modèle graphique est parfois utilisé pour indiquer cette fréquence, en augmentant ou en diminuant la taille des symboles.Certains logiciels peuvent générer automatiquement des logos de séquences.

Souvent, une séquence consensus correspond à un site de liaison protéique reconnu.Pour représenter avec précision les séquences sur le génome, des formules mathématiques sont souvent utilisées.Il s'agit notamment de formules statistiques telles que les logarithmes et les valeurs numériques, qui peuvent être positives ou négatives, pour représenter l'emplacement des informations génétiques.Les processus dans le génome des fonctions biologiques normales, ainsi que ceux liés aux maladies, peuvent être analysés de cette manière.

Les représentations mathématiques d'une séquence de consensus fournissent généralement un modèle de motifs d'ADN et d'acides aminés.Une image exacte n'est généralement pas fournie.Les séquences, cependant, peuvent aider les scientifiques à relier les aspects fonctionnels de différentes parties du génome aux modèles évolutifs des organismes.