In biologia, cos'è una sequenza di consenso?

Una sequenza di consenso è un insieme di proteine ​​o nucleotidi nell'acido desossiribonucleico (DNA), che appare regolarmente. Gli aminoacidi adenina, guanina, citosina e timina formano sequenze genetiche nel DNA. I biologi molecolari usano spesso le statistiche per prevedere dove si troverà una loro sequenza o per capire dove determinate molecole tendono a legarsi. Dove le sequenze di amminoacidi rimangono le stesse e dove tendono a variare possono essere rappresentate da una formula. Nel caso di una sequenza di promotori del consenso, un particolare tipo di enzima può legarsi a siti di proteine ​​con sequenze simili.

I genetisti, come i ricercatori di molte discipline scientifiche, usano spesso sostituzioni per semplificare sistemi complessi. Ci sono così tante basi amminoacidiche e geni nel corpo che gli scienziati non possono contarli a meno che non ci sia un sistema generale per farlo. Una sequenza di consenso può apparire in molte posizioni nel DNA e in vari esseri viventi. Le somiglianze e le differenze che tendono a verificarsi possono essere indicate da una formula.

Statisticamente, gli scienziati possono classificare sequenze genetiche per cercare schemi. Gli schemi ripetitivi, chiamati motivi di sequenza, sono generalmente usati per rappresentare aree genetiche che controllano specifici processi biologici. Le sequenze di consenso possono anche fornire informazioni su come sono sintetizzate le proteine ​​o su come le molecole sono guidate all'interno di una cellula.

Nella notazione di una sequenza di consenso, la posizione di alcuni nucleotidi può mostrare che si trovano sempre nella posizione rappresentata. Si può anche indicare che un nucleotide o un altro possono essere lì. In questo caso, la frequenza con cui appare un amminoacido, al posto di un altro, non è generalmente indicata. Talvolta viene utilizzato un modello grafico per indicare questa frequenza, aumentando o diminuendo la dimensione dei simboli. Alcuni programmi software possono generare automaticamente loghi di sequenza.

Spesso, una sequenza di consenso coincide con un sito di legame proteico riconosciuto. Per rappresentare con precisione sequenze sul genoma, vengono spesso utilizzate formule matematiche. Questi includono formule statistiche come logaritmi e valori numerici, che possono essere positivi o negativi, per rappresentare la posizione delle informazioni genetiche. I processi nel genoma per le normali funzioni biologiche, così come quelli relativi alle malattie, possono essere analizzati in questo modo.

Le rappresentazioni matematiche di una sequenza di consenso generalmente forniscono un modello di DNA e modelli di aminoacidi. Generalmente non viene fornita un'immagine esatta. Le sequenze, tuttavia, possono aiutare gli scienziati a mettere in relazione gli aspetti funzionali delle diverse parti del genoma con i modelli evolutivi degli organismi.