Co je to v biologii konsensuální sekvence?

Konsenzuální sekvence je sada proteinů nebo nukleotidů v deoxyribonukleové kyselině (DNA), která se objevuje pravidelně. Aminokyseliny adenin, guanin, cytosin a thymin tvoří genetické sekvence v DNA. Molekulární biologové často používají statistiku k predikci, kde bude určitá jejich sekvence, nebo aby pochopila, kde se konkrétní molekuly váže. Tam, kde aminokyselinové sekvence zůstávají stejné a tam, kde mají tendenci se lišit, mohou být reprezentovány vzorcem. V případě sekvence promotoru konsensu se může konkrétní typ enzymu vázat na místa podobně sekvenovaných proteinů. V těle je tolik aminokyselin a genů, že je vědci nemohou spočítat, pokud k tomu neexistuje nějaký obecný systém. Sekvence konsensu se může objevit na mnoha místech v DNA i v různých živých věcech. Podobnosti a rozdíly, které mají tendenci dochází kn být označen vzorcem.

Statisticky mohou vědci klasifikovat genetické sekvence, aby hledali vzory. Opakující se vzory, nazývané sekvenční motivy, se obecně používají k reprezentaci genetických oblastí, které řídí specifické biologické procesy. Konsenzuální sekvence mohou také nabídnout vhled do toho, jak jsou proteiny syntetizovány nebo jak jsou molekuly vedeny v buňce.

V zápisu konsensuální sekvence může umístění některých nukleotidů ukázat, že jsou vždy v reprezentovaném místě. Lze také naznačit, že tam může být jeden nebo druhý nukleotid. V tomto případě, jak často se objevuje aminokyselina místo jiného, ​​obecně není uvedeno. Grafický model se někdy používá k označení této frekvence zvýšením nebo snižováním velikosti symbolů. Některé softwarové programy mohou generovat sekvenční loga automaticky.

Často se konsenzuální sekvence shoduje s recOgnizované vazebné místo proteinu. K přesnému zobrazení sekvencí na genomu se často používají matematické vzorce. Patří mezi ně statistické vzorce, jako jsou logaritmy a numerické hodnoty, které mohou být pozitivní nebo negativní, reprezentovat umístění genetických informací. Procesy v genomu pro normální biologické funkce, stejně jako procesy související s nemocemi, lze analyzovat tímto způsobem.

Matematické reprezentace konsensuální sekvence obecně poskytují model vzorců DNA a aminokyselin. Přesný obrázek není obvykle poskytnut. Sekvence však mohou vědcům pomoci spojit funkční aspekty různých částí genomu s evolučními vzory organismů.