Wat is een kilobase?

Een kilobase is een nummeringsmeting die wordt gebruikt op het gebied van genetica. Omdat een base een bouwsteen van genetische informatie is en elk organisme veel basen bevat, is 1.000 basen een veelgebruikt getal om te gebruiken bij de bespreking van hoeveel basen de genetische bibliotheek van een organisme bevat. Deze brok van 1000 basen wordt beter een kilobase genoemd.

Elk levend organisme bevat genetische informatie. Deze informatie geeft het organisme precies weer welke eiwitproducten het organisme nodig heeft om te leven, groeien en zich te vermenigvuldigen. Alle genetische informatie samen wordt het genoom van het organisme genoemd.

Elk genoom is opgedeeld in afzonderlijke secties. Deze secties, genen genoemd, coderen voor een bepaald product. Elk gen bevat een reeks bouwstenen, basen genoemd. Wanneer het organisme de genen leest om een ​​bepaald product te produceren, is het de reeks basen in het gen die het leest.

Er bestaan ​​slechts vier basen in het genetische materiaal DNA. Dit zijn cytosine (C), guanine (G), thymine (T) en adenine (A). Het is de volgorde waarin de bases zijn gerangschikt in een gen dat dicteert waarvoor dat gen codeert. De complexiteit die nodig is om alle producten te produceren die essentieel zijn voor het menselijk leven komt voort uit de lengte van de genen en het aantal basen erin.

Genen bevatten elk een opmerkelijk aantal basen. Het hele menselijke genoom bevat bijvoorbeeld 3 miljard basen, elk gekoppeld aan een andere base in een spiraalvormige helixstructuur. Het grote aantal basen dat in een genoom aanwezig is, betekent dat genetici het gemakkelijker vinden om naar genen te verwijzen als zijnde x kilobasen lang, in tegenstelling tot 1000 keer x lang.

Zelfs de kleinste genomen, zoals het Carsonella ruddii- bacteriegenoom, bevatten ongeveer 160.000 basenparen. Dit kleine genoom is ongeveer 160 kilobasen (kb) lang. Het menselijke genoom is daarentegen 3 miljoen kilobaseparen lang.

Sequencing van genomen vereist dat het genoom eerst wordt opgebroken. Apparatuur die de sequencing uitvoert, kan slechts zoveel bases tegelijk aan. Genetici kunnen een genoom opsplitsen in vele secties en verwijzen naar hen die zoveel kilobaseparen bevatten, zoals een lengte van 150 kilobaseparen. Deze grootte van genetisch materiaal kan genetisch worden gemodificeerd in een ander organisme om het DNA te vermenigvuldigen tot een niveau dat gemakkelijk leesbaar is. Zelfs deze relatief kleine stukjes DNA zijn te lang om rechtstreeks te sequencen, dus genetici kunnen dan een segment van 150 kb opdelen in veel kleinere porties van enkele honderden basen lang.