Hva er en kilobase?
En kilobase er en nummereringsmåling som brukes innen genetikk. Ettersom basen er en byggestein med genetisk informasjon, og hver organisme inneholder mange baser, er 1.000 baser et vanlig tall å bruke når vi diskuterer hvor mange baser en organisms genetiske bibliotek inneholder. Denne 1000 basebiten er mer korrekt referert til som en kilobase.
Hver levende organisme inneholder genetisk informasjon. Denne informasjonen stave eksplisitt til organismen hvilke proteinprodukter organismen trenger for å leve, vokse og formere seg. All den genetiske informasjonen kalles organismen genom.
Hvert genom er delt i separate seksjoner. Disse seksjonene, kalt gener, koder for et bestemt produkt. Hvert gen inneholder en streng med byggesteiner, kalt baser. Når organismen leser genene for å produsere et bestemt produkt, er det sekvensen av baser inne i genet som den leser.
Det er bare fire baser i genetisk materiale DNA. Disse er cytosin (C), guanin (G), timin (T) og adenin (A). Det er rekkefølgen basene er ordnet i et gen som dikterer hva det genet koder for. Kompleksiteten som er nødvendig for å produsere alle produktene som er essensielle for menneskelivet, stammer fra lengden på gener og antall baser i dem.
Gener inneholder hver et bemerkelsesverdig antall baser. Hele menneskets genom inneholder for eksempel 3 milliarder baser, hver sammenkoblet med en annen base i en spiral spiralstruktur. Den store mengden baser som er til stede i et genom gjør at genetikere synes det er lettere å referere til gener som å være x kilobaser i lengde, i motsetning til 1000 ganger x i lengde.
Selv det minste av genomer, for eksempel Carsonella ruddii- bakteriegenomet, har rundt 160 000 basepar. Dette bittesmå genomet er omtrent 160 kilobaser (kb) i lengde. Det menneskelige genomet er derimot 3 millioner kilobasepar i lengde.
Sekvensering av genom krever at genomet brytes opp først. Utstyr som utfører sekvenseringen kan bare håndtere så mange baser samtidig. Genetikere kan dele opp et genom i mange seksjoner og referere til dem som å inneholde så mange kilobase-par, for eksempel en lengde på 150 kilobase-par. Denne størrelsen på genetisk materiale kan genetisk manipuleres til en annen organisme for å multiplisere DNAet opp til et nivå som er lett lesbar. Til og med disse relativt små DNA-bitene er for lange til direkte å sekvensere, så genetikere kan da bryte opp et 150 kb segment i mye mindre deler av noen hundre baser i lengden.