Hvad er en kilobase?

En kilobase er en nummereringsmåling, der bruges inden for genetik. Da en base er en byggesten af ​​genetisk information, og hver organisme indeholder mange baser, er 1.000 baser et almindeligt antal, der skal bruges, når vi diskuterer, hvor mange baser en organisms genetiske bibliotek indeholder. Denne 1.000 basestykke kaldes mere korrekt som en kilobase.

Hver levende organisme indeholder genetisk information. Denne information staver til organismen nøjagtigt hvilke proteinprodukter organismen har brug for for at leve, vokse og formere sig. Al den genetiske information kaldes organismens genom.

Hvert genom er opdelt i diskrete sektioner. Disse sektioner, kaldet gener, koder for et bestemt produkt. Hvert gen indeholder en streng af byggesten, kaldet baser. Når organismen læser generne for at producere et bestemt produkt, er det sekvensen af ​​baser inde i genet, den læser.

Der findes kun fire baser i genetisk materiale DNA. Disse er cytosin (C), guanin (G), thymin (T) og adenin (A). Det er i den rækkefølge baserne er arrangeret i et gen, der dikterer, hvad genet koder for. Kompleksiteten, der er nødvendig for at fremstille alle produkter, der er essentielle for menneskers liv, stammer fra længden af ​​generne og antallet af baser deri.

Gener indeholder hver især et bemærkelsesværdigt antal baser. Hele det menneskelige genom, for eksempel, indeholder 3 milliarder baser, hver parret med en anden base i en spiralhelixstruktur. Den store mængde baser, der findes i et genom, betyder, at genetikere finder det lettere at referere til gener som at være x kilobaser i længde, i modsætning til 1.000 gange x i længden.

Selv den mindste af genomer, såsom Carsonella ruddii- bakteriegenomet, indeholder ca. 160.000 basepar. Dette lille genom er cirka 160 kilobaser (kb) i længden. Det menneskelige genom er på den anden side 3 millioner kilobasepar i længde.

Sekventering af genom kræver, at genomet først brydes op. Udstyr, der udfører sekventeringen, kan kun håndtere så mange baser ad gangen. Genetikere kan opdele et genom i mange sektioner og henvise til dem som at indeholde så mange kilobase-par, såsom en længde på 150 kilobase-par. Denne størrelse af genetisk materiale kan genetisk manipuleres til en anden organisme for at formere DNA'et op til et niveau, der er let læseligt. Selv disse relativt små DNA-stykker er for lange til direkte sekventering, så genetikere kan derefter opbryde et 150 kb-segment i meget mindre dele af et par hundrede baser i længden.