Hvad er en kilobase?
En kilobase er en nummereringsmåling, der bruges inden for genetik. Som base er en byggesten af genetisk information, og enhver organisme indeholder mange baser, er 1.000 baser et almindeligt antal, der skal bruges, når man diskuterer, hvor mange baser en organisms genetiske bibliotek indeholder. Denne 1.000 basechunk omtales mere korrekt som en kilobase.
Hver levende organisme indeholder genetisk information. Denne information stave ud til organismen, nøjagtigt hvilke proteinprodukter organismen har brug for for at leve, vokse og multiplicere. Al den genetiske information sammen kaldes organismenes genom.
Hvert genom er opdelt i diskrete sektioner. Disse sektioner, kaldet gener, kode for et bestemt produkt. Hvert gen indeholder en række byggesten, kaldet baser. Når organismen læser generne for at producere et bestemt produkt, er det sekvensen af baser inde i genet, som den læser.
kun fire baser findes i det genetiske materiale -DNA. Disse er cytosin (c), guanine (g), tHymin (T) og adenin (A). Det er den rækkefølge, hvor baserne er arrangeret i et gen, der dikterer, hvad det genkoder for. Den kompleksitet, der er nødvendig for at producere alle de produkter, der er essentielle for menneskeliv, opstår som følge af generne og antallet af baser inde i dem.
Gener indeholder hver et bemærkelsesværdigt antal baser. Hele humane genomet indeholder for eksempel 3 milliarder baser, der hver er parret med en anden base i en spiral helixstruktur. Den store mængde baser, der er til stede i et genom, betyder, at genetikere finder det lettere at referere til gener som x kilobaser i længden i modsætning til 1.000 gange x i længden.
Selv de mindste af genomer, såsom carsonella ruddii bakterie genom, har ca. 160.000 basepar. Dette lille genom er omkring 160 kilobaser (KB) i længden. Det menneskelige genom er på den anden side 3 millioner kilobasepar i længden.
seQuencing af genomer kræver, at genomet først opdeles. Udstyr, der udfører sekventeringen, kan kun håndtere så mange baser på én gang. Genetikere kan opdele et genom i mange sektioner og omtale dem som indeholdende så mange kilobasepar, såsom en længde på 150 kilobasepar. Denne størrelse af genetisk materiale kan genetisk konstrueres til en anden organisme for at multiplicere DNA'et op til et niveau, der let kan læses. Selv disse relativt små DNA-stykker er for lange til sekventering direkte, så genetikere kan derefter nedbryde et 150 kb-segment i meget mindre dele af et par hundrede baser i længden.