Co je to molekulární grafika?

Termín Graphics odkazuje na výkresy nebo obrázky, které jsou vytvořeny podle pravidel matematiky. molekulární odkazuje na molekuly a jejich komponenty. Jedním z významů molekulární grafiky je proto studium molekul vizualizací samotných molekul a jejich součástí. Molekulární grafika také odkazuje na trojrozměrné zobrazení molekul, které jsou vytvářeny, aby je prozkoumaly a porozuměly jejich odpovědi během reakcí a interakcí

molekulární grafika má určité výhody oproti fyzickým modelům. Fyzikální modely mohou způsobit problémy, protože struktura je zakrytá, existuje nepravdivý dojem flexibility, superpozice je téměř nemožné, nebo jsou prostě příliš těžkopádné na to, aby mohli pracovat. Všechny tyto problémy lze překonat pomocí počítačové grafiky. Výzkumná spolupráce pro protein strukturální bioinformatiky (RCSB)Datová banka (PDB), ve kterých jsou pro obecný přístup uloženy experimentálně stanovené informace o strukturách nukleových kyselin, proteinů a komplexních sestav. Od 27. dubna 2010 bylo v databázi 64 932 struktur. RCSB popularizuje svou funkci pozváním návštěvníkům, aby na Rutgers University v Rutgers Day vybudovali modely 3D virů. RCSB také sponzoruje studie modelování proteinů na regionálních vědeckých olympiádách ve Spojených státech. Celosvětová proteinová datová banka (WWPDB) je mezinárodní organizací, do které skupiny jako RCSB; Pdbe, evropský protějšek; a PDBJ, japonský protějšek; patří.

Další oblastí, ve které je molekulární grafika nesmírně důležitá, je návrh léčiv. Molekulární grafika Návrh asistovaného léčiva-známý také jako počítačový design léčiva (CADD), molekulární design podporovaný počítačem (CAMD) nebo lék založený na struktuřeDesign (SBDD) - je například jedním z klíčových výzkumných zájmů fakulty zapojených do specializace léčivé chemie ve Virginii Commonwealth University na postgraduálních programech farmaceutických věd.

Specializovaný software pro vytvoření molekulární grafiky, nazývaný Molecular Design Software , je k dispozici v řadě komerčních balíčků. Existují také konkrétní verze zaměřené na návrh léčiva založeného na molekulární grafice. V návrhu léčiva je funkce Docking - schopnost připojit zobrazenou molekulu k receptoru - jedním z klíčových atributů, které odlišují software pro návrh léčiva, vytvářejí další software molekulárního designu.