O que são gráficos moleculares?
O termo gráficos refere-se a desenhos ou imagens criados seguindo as regras da matemática. Molecular refere-se a moléculas e seus componentes. Portanto, um significado dos gráficos moleculares (MG) é o estudo de moléculas através da visualização das próprias moléculas e de seus componentes. Os gráficos moleculares também se referem às representações tridimensionais de moléculas que são feitas para examiná-las e entender suas respostas durante reações e interações
Os gráficos moleculares têm certas vantagens sobre os modelos físicos. Os modelos físicos podem causar problemas porque a estrutura está obscurecida, há uma falsa impressão de flexibilidade, a sobreposição é quase impossível, ou eles são simplesmente muito pesados para trabalhar. Todos esses problemas podem ser superados com gráficos de computador.
Um uso chave dos gráficos moleculares está no estudo de proteínas e ácidos nucleicos. O banco de dados de proteínas (PDB) (Collaborative Research for Bioinformtics Estruturais) (RCSB), no qual informações armazenadas experimentalmente sobre as estruturas de ácidos nucleicos, proteínas e conjuntos complexos são armazenadas para acesso geral. Em 27 de abril de 2010, havia 64.932 estruturas no banco de dados. O RCSB populariza sua função com um convite aos visitantes para criar modelos de vírus 3D na Universidade Rutgers no dia Rutgers. O RCSB também patrocina ensaios de modelagem de proteínas nas Olimpíadas de Ciências regionais nos Estados Unidos. O Banco Mundial de Dados de Proteína (wwPDB) é a organização internacional para a qual grupos como RCSB; PDBe, a contraparte europeia; e PDBj, a contraparte japonesa; pertencer.
Outra área em que os gráficos moleculares são extremamente importantes é o design de produtos farmacêuticos. O design de medicamentos assistidos por gráficos moleculares - também conhecido como design de medicamentos assistidos por computador (CADD), design molecular assistido por computador (CAMD) ou design de medicamentos baseado em estrutura (SBDD) - é um dos principais interesses de pesquisa dos professores envolvidos na Especialização em Química Medicinal da Virginia Commonwealth University nos programas de pós-graduação em Ciências Farmacêuticas, por exemplo.
Software especializado para criar gráficos moleculares, chamado software de design molecular , está disponível em vários pacotes comerciais. Também existem versões dedicadas ao design de medicamentos baseados em gráficos moleculares. No design de medicamentos, o recurso de encaixe - a capacidade de conectar uma molécula exibida a um receptor - é um dos principais atributos que distinguem o software de design de medicamentos de outro software de design molecular.