¿Qué son los gráficos moleculares?
El término gráficos se refiere a dibujos o imágenes que se crean siguiendo las reglas de las matemáticas. Molecular se refiere a las moléculas y sus componentes. Por lo tanto, un significado de los gráficos moleculares (MG) es el estudio de las moléculas a través de la visualización de las moléculas mismas y sus componentes. Los gráficos moleculares también se refieren a las representaciones tridimensionales de las moléculas que se hacen para examinarlas y comprender sus respuestas durante las reacciones e interacciones.
Los gráficos moleculares tienen ciertas ventajas sobre los modelos físicos. Los modelos físicos pueden causar problemas porque la estructura está oscurecida, hay una falsa impresión de flexibilidad, la superposición es casi imposible o simplemente son demasiado engorrosos para trabajar. Todos estos problemas pueden superarse con gráficos por computadora.
Un uso clave de los gráficos moleculares es el estudio de proteínas y ácidos nucleicos. El Banco de datos de proteínas (PDB) de Research Collaboratory for Structural Bioinformatics (RCSB), en el que la información determinada experimentalmente sobre las estructuras de ácidos nucleicos, proteínas y conjuntos complejos se almacena para acceso general. A partir del 27 de abril de 2010, había 64.932 estructuras en la base de datos. El RCSB populariza su función con una invitación a los visitantes a construir modelos de virus 3D en la Universidad de Rutgers el día de Rutgers. El RCSB también patrocina ensayos de modelado de proteínas en las Olimpiadas de Ciencias regionales en los Estados Unidos. El Banco Mundial de Datos de Proteínas (wwPDB) es la organización internacional a la cual grupos como RCSB; PDBe, la contraparte europea; y PDBj, la contraparte japonesa; pertenecer a.
Otra área en la que los gráficos moleculares es extremadamente importante es el diseño de productos farmacéuticos. El diseño de medicamentos asistido por gráficos moleculares, también conocido como diseño de medicamentos asistido por computadora (CADD), diseño molecular asistido por computadora (CAMD) o diseño de medicamentos basado en estructuras (SBDD), es uno de los principales intereses de investigación de la facultad involucrada en el Virginia Commonwealth University, especialización en Química Medicinal en los programas de posgrado de Ciencias Farmacéuticas, por ejemplo.
El software especializado para crear gráficos moleculares, llamado software de diseño molecular , está disponible en varios paquetes comerciales. También hay versiones particulares dedicadas al diseño de fármacos basados en gráficos moleculares. En el diseño de fármacos, la característica de acoplamiento ( la capacidad de conectar una molécula mostrada a un receptor) es uno de los atributos clave que distingue al software de diseño de fármacos de otro software de diseño molecular.