Co to jest grafika molekularna?
Termin grafiki odnosi się do rysunków lub obrazów tworzonych zgodnie z regułami matematyki. Molecular odnosi się do cząsteczek i ich składników. Dlatego jednym znaczeniem grafiki molekularnej (mg) jest badanie cząsteczek poprzez wizualizację samych cząsteczek i ich części składowych. Grafika molekularna odnosi się również do trójwymiarowych przedstawień cząsteczek, które powstają w celu ich zbadania i zrozumienia ich odpowiedzi podczas reakcji i interakcji
Graphics molekularna mają pewne zalety w stosunku do modeli fizycznych. Modele fizyczne mogą powodować problemy, ponieważ struktura jest zasłonięta, istnieje fałszywe wrażenie elastyczności, nałożenie jest prawie niemożliwe lub są po prostu zbyt uciążliwe do pracy. Wszystkie te problemy można pokonać za pomocą grafiki komputerowej.
Jednym z kluczowych zastosowań grafiki molekularnej jest badanie białek i kwasów nukleinowych. Badania Współpraca na temat białka Bioinformatics Structural Bioinformatics (RCSB)Bank danych (PDB), w których eksperymentalnie określone informacje o strukturach kwasów nukleinowych, białek i złożonych zespołów są przechowywane w celu uzyskania ogólnego dostępu. Na dzień 27 kwietnia 2010 r. W bazie danych znajdowało się 64 932 struktury. RCSB popularyzuje swoją funkcję dzięki zaproszeniu do odwiedzających do budowy modeli wirusów 3D na Uniwersytecie Rutgers w Rutgers Day. RCSB sponsoruje również próby modelowania białek na regionalnych olimpiadach naukowych w Stanach Zjednoczonych. Światowy bank danych białkowych (WWPDB) to międzynarodowa organizacja, do której grupy takie jak RCSB; PDBE, europejski odpowiednik; i PDBJ, japoński odpowiednik; należą.
Kolejnym obszarem, w którym grafika molekularna jest niezwykle ważna, jest projekt farmaceutyków. Projektowanie leków wspomagane molekularną-znane również jako wspomagane komputerowo leki (CADD), komputerowy projekt molekularny (CAMD) lub leku oparty na strukturzeDesign (SBDD) - jest jednym z kluczowych zainteresowań badawczych wydziału zaangażowanych w specjalizację chemii leczniczej Virginia Commonwealth University w programach dla absolwentów nauk farmaceutycznych.
Specjalistyczne oprogramowanie do tworzenia grafiki molekularnej, zwane oprogramowaniem do projektowania molekularnego , jest dostępne w wielu pakietach komercyjnych. Istnieją również szczególne wersje poświęcone projektowaniu leków opartych na molekularnych grafikach. W projektowaniu leków funkcja zadokowania - możliwość połączenia wyświetlonej cząsteczki z receptorem - jest jednym z kluczowych atrybutów, które wyróżniały oprogramowanie do projektowania leków, inne oprogramowanie do projektowania molekularnego.