分子グラフィックスとは
グラフィックスという用語は、数学の規則に従って作成された図面または画像を指します。 分子とは、分子とその成分を指します。 したがって、 分子グラフィックス (MG)の1つの意味は、分子自体とその構成要素の視覚化による分子の研究です。 分子グラフィックスとは、反応および相互作用中の分子を調べて応答を理解するために作成される分子の3次元描写も指します。
分子グラフィックスには、物理モデルに比べて特定の利点があります。 物理モデルは、構造が不明瞭であるため、柔軟性の誤った印象があるため、重ね合わせがほとんど不可能であるか、単に扱いにくいために問題を引き起こす可能性があります。 これらの問題はすべて、コンピューターグラフィックスで克服できます。
分子グラフィックスの重要な用途の1つは、タンパク質と核酸の研究です。 構造バイオインフォマティクス研究共同体(RCSB)タンパク質データバンク(PDB)には、一般的なアクセスのために、核酸、タンパク質、および複雑なアセンブリの構造に関する実験的に決定された情報が格納されます。 2010年4月27日の時点で、データベースには64,932の構造がありました。 RCSBは、Rutgers DayにRutgers Universityで3Dウイルスモデルを作成するように訪問者を招待して、機能を普及させています。 また、RCSBは、米国の地域のサイエンスオリンピックでのタンパク質モデリング試験のスポンサーとなっています。 Worldwide Protein Data Bank(wwPDB)は、RCSBなどのグループが参加する国際組織です。 欧州のPDBe; PDBj、日本のカウンターパート。 属する。
分子グラフィックスが非常に重要なもう1つの分野は、医薬品の設計です。 コンピューター支援薬物設計(CADD)、コンピューター支援分子設計(CAMD)、または構造に基づく薬物設計(SBDD)としても知られる分子グラフィック支援薬物設計は、学部の主要な研究関心の1つです。たとえば、バージニアコモンウェルス大学の薬化学専攻は、薬学の大学院プログラムです。
分子設計ソフトウェアと呼ばれる分子グラフィックスを作成するための専用ソフトウェアは、多くの商用パッケージで利用できます。 分子グラフィックスに基づく薬物設計専用の特定のバージョンもあります。 薬物設計では、 ドッキングの機能(表示された分子を受容体に接続する機能)は、薬物設計ソフトウェアを他の分子設計ソフトウェアと区別する重要な属性の1つです。