Co je ribozomální RNA?

Kyselina ribosomální ribonukleová (ribozomální RNA nebo rRNA) pomáhá formovat samotný ribozom. Na rozdíl od messengerové RNA (mRNA), ribozomální RNA nepřenáší genetickou informaci. Místo toho se kombinuje s proteiny a vytváří strukturu, která systematicky transformuje mRNA na proteiny.

Ústředním dogmatem buněčné biologie je to, že DNA se přepisuje do RNA, která se převádí na proteiny. Druhý krok v tomto procesu, translace, je prováděn ribozomem. Ribozom zachycuje mRNA, která pak vyžaduje specifické aminokyseliny k vytvoření proteinu, o kterém obsahuje informace. Ribozomální RNA tvoří komplex s různými proteiny, aby se aminokyseliny spojily dohromady.

Ribozomy mohou volně plavat v buněčné cytoplazmě nebo mohou být vázány na membránu zvanou endoplazmatické retikulum (ER). ER, který obsahuje ribozomy, se nazývá hrubý ER. Proteiny produkované v hrubém ER jsou přepravovány přes ER do konkrétních destinací. Ribosomy se mohou objevit také v různých velikostech. Větší ribozomy jednoduše obsahují opakované kopie stejné základní ribozomální RNA.

Ribozomální RNA se jeví jako dvě oddělené části, které fungují společně. Jsou to velká podjednotka (LSU) a malá podjednotka (SSU). LSU a SSU pohybují smoothy v tandemu podél řetězce mRNA, které překládají. LSU přitahuje molekuly transferové RNA (tRNA), které nesou potřebné aminokyseliny.

Část ribozomu - na setkání dvou podjednotek -, která vykonává práci spojování aminokyselin, se nazývá peptidyltransferáza. Je to katalyzátor: usnadňuje chemickou reakci vytvářením prostředí, ve kterém může reakce snadno probíhat. Jako takový se nazývá ribozym a je jedním z mála organických katalyzátorů, které nejsou proteiny.

Živé organismy obsahují několik stovek kopií genů potřebných pro dvě molekuly ribozomální RNA. Tato hojnost a nadbytečnost odrážejí klíčovou roli, kterou ribozomální RNA hraje při podpoře procesu života. Na Zemi není znám žádný organismus, který by byl schopen fungovat bez rRNA.

Ribozomální RNA je stejně tak základní a rozšířená mezi bakteriemi jako v živočišné říši. V důsledku toho mnoho antibiotik cílí na ribozomální RNA v bakteriích. Tato rRNA je dostatečně jedinečná, aby mohla být zacílena bez zabití infikovaného organismu, ale také dostatečně podobná u bakterií, že jednotlivá antibiotika mohou zabíjet mnoho různých kmenů. Mnoho z těchto antibiotik jsou přirozeně se vyskytující chemikálie: produkty s výhodami, které mohou bakterie získat tím, že se navzájem zabijí nezávisle!