Hvad er en Alpha Helix?
Proteiner er vigtige for livet og findes i mange former. Deres struktur kan variere, hvilket kan have en betydelig effekt på aminosyrernes funktioner og forskellige biologiske funktioner. En alfa-helix består af en kæde af aminosyrer, der er bundet af brint, og klassificerer helixen som en sekundær proteinstruktur. Den er typisk 10 aminosyrer lang og har egenskaber, der ligner en fjeder. Krafter, der kan bryde bindingerne, kan beskadige en enkelt helix såvel som cellernes struktur og binding af deoxyribonucleic acid (DNA).
Hvis en alfa-helix går i stykker, kan det få andre lokale proteiner til at slappe af. Cellulære funktioner og højere biologiske funktioner kan forstyrres. Alfa-helikser lagrer energi i deres bindinger, og det kræver en kraft, der er stærk nok til at bryde hver binding for at få strukturer til at afsløre deres form. De findes i forskellige motiver, såsom helix-turn-helix-motiver, og har en diameter, der er lig med en rille i DNA.
Protein-alfa-helixen fungerer som en strukturelt understøttende komponent til DNA og til cellulære cytoskeletter i større skala. Ved større biologiske dimensioner er alfa-helikser vigtige i konstruktionen af hår såvel som uld og hove. De tjener også en rolle i sammensætningen af andre strukturer, såsom alfa-helix-betaarket, hvor to eller flere kæder af aminosyrer sidder parallelt. Der er flere brintbindinger, der dannes mellem trådene på beta-arket for at danne en stiv struktur. Den ene side kan være resistent over for vandmolekyler, mens den anden lades og er i stand til at interagere med eller ændres af vand.
Polarladning er en medvirkende faktor til stabilitet. En alfa-helix er typisk positivt ladet i den ene ende og negativt ladet i den anden, hvilket kan destabilisere strukturen. En negativt ladet aminosyre sidder normalt i den positive ende, men nogle gange findes et positivt ladet protein i den negative ende i stedet. Begge arrangement stabiliserer helixen og holder den intakt.
Hver alfa-helix er submikroskopisk, men har en grad af mekanisk holdbarhed, selv på molekylært niveau. Et vist niveau af elasticitet og styrke tilskrives proteinerne, men effekten af mekanisk belastning på disse strukturer er ikke fuldt ud forstået. Hvordan enhver deformation eller fiasko sker, vides ikke, men hvis brud og afvikling opstår, kan det være skadeligt for cellerne og organismenes biologiske funktioner.