Wat zijn de verschillende soorten RNA-isolatiesets?

De meeste isolatiekits voor ribonucleïnezuur (RNA) kunnen RNA van hoge kwaliteit isoleren uit een breed scala aan weefsels en soorten organismen, waaronder planten, dieren en virussen. Mitochondriaal en ribosomaal RNA - respectievelijk mRNA en rRNA - kunnen gespecialiseerde RNA-isolatiekits vereisen die specifiek zijn voor kleine RNA-strengen. Andere factoren die tussen verschillende isolatiekits kunnen verschillen, zijn het aantal monsters dat elke kit kan verwerken en de tijd die nodig is om een ​​monster volledig te verwerken.

De meest voorkomende soorten RNA-isolatiekits kunnen worden gebruikt voor een grote verscheidenheid aan toepassingen, ongeacht waar het RNA vandaan komt. Zoogdiercellen en -weefsels behoren tot de meest overheersende bronnen die worden gebruikt voor RNA-isolatie en -zuivering. Plantencellen en virussen worden ook gebruikt in moleculaire biologie-experimenten die het gebruik van een RNA-isolatiekit vereisen.

Nadat het weefsel- of bloedmonster is verzameld, moet het worden voorbereid op RNA-isolatie tijdens een kritisch proces dat bekend staat als cellulaire afbraak, scheiding of verstoring. Als het cellulaire materiaal niet volledig wordt verstoord, zal het RNA-isolatieproces minder RNA produceren. De beste RNA-isolatiekits omvatten materialen en benodigdheden voor cellulaire afbraak voorafgaand aan isolatie en RNA-zuivering na isolatie.

In speciale gevallen waar een experiment mRNA of rRNA vereist, zijn gespecialiseerde RNA-isolatiekits beschikbaar voor RNA-strengen die bijzonder klein zijn. De materialen en benodigdheden in een dergelijke set kunnen verschillen in hoeveelheid en grootte. Deze RNA-isolatiekits komen minder vaak voor dan de multifunctionele RNA-kits en er kan een aanzienlijk kostenverschil zijn.

Veel gebruikelijke RNA-isolatiekits zijn ontworpen voor gebruik met alle soorten weefsels en cellen en kunnen een reactie binnen ongeveer 20 minuten voltooien. De tijd die nodig is voor volledige cellulaire afbraak kan variëren, afhankelijk van waar in het organisme de cellen werden verzameld. Voorbij de stap van cellulaire afbraak zijn het RNA-isolatieproces en de daaropvolgende zuivering relatief standaard in termen van procedure en tijd.

Een ander kenmerk dat specifiek kan zijn voor bepaalde kits, is de hoeveelheid monster die nodig is om de reactie te verwerken. Hoewel sommige isolatiekits een relatief groot monstervolume vereisen, kunnen andere kits goed werken met een kleiner volume. Dit verschil kan een voordeel zijn als het monstervolume een beperkende factor is.

Verschillende fabrikanten van RNA-isolatiekits hebben vergelijkingsgrafieken op internet beschikbaar. Deze grafieken kunnen worden gebruikt om de verschillen te zien tussen de verschillende kits die ze produceren. De verschillen kunnen gespecialiseerde applicatietypen, chemicaliën en vereiste monstervolumes omvatten.