Jaké jsou různé typy souprav izolace RNA?

Většina izolačních sad ribonukleové kyseliny (RNA) může izolovat vysoce kvalitní RNA z širokého rozsahu tkání a typů organismů, včetně rostlin, zvířat a virů. Mitochondriální a ribozomální RNA - mRNA a rRNA - mohou vyžadovat specializované izolační soupravy RNA specifické pro malé prameny RNA. Dalšími faktory, které se mohou lišit mezi různými izolačními soupravami, jsou množství vzorků, které každá sada může zpracovat, a čas potřebný k úplnému zpracování vzorku. Savčí buňky a tkáně patří mezi nejvíce převládající zdroje používané pro izolaci a čištění RNA. Rostlinné buňky a viry se také používají v experimentech molekulární biologie, které vyžadují použití soupravy izolace RNA.o narušení nebo narušení. Pokud buněčný materiál není dokončen narušen, proces izolace RNA bude produkovat méně RNA. Nejlepší sady izolace RNA zahrnují materiály a zásoby pro degradaci buněk před izolací a čištění RNA po izolaci.

Ve zvláštních případech, kdy experiment vyžaduje mRNA nebo rRNA, jsou pro řetězce RNA k dispozici specializované sady izolace RNA, které jsou zvláště malé. Materiály a zásoby obsažené v takové sadě se mohou lišit z hlediska množství a velikosti. Tyto izolační soupravy RNA jsou méně běžné než sady RNA s víceúčelovými RNA a může existovat značný rozdíl v nákladech.

Mnoho běžných izolačních souprav RNA je navrženo pro použití se všemi typy tkání a buněk a může dokončit reakci přibližně do 20 minut. Čas potřebný k úplné degradaci buněk se může lišit v závislosti na tom, kde v organismu byly buňky ColLetovaný. Kromě kroku buněčné degradace jsou proces izolace RNA a následné čištění relativně standardní z hlediska postupu a času.

Další funkce, která může být specifická pro určité soupravy, je množství vzorku potřebného ke zpracování reakce. Zatímco některé izolační soupravy mohou vyžadovat relativně velký objem vzorku, jiné soupravy mohou dobře fungovat s menším objemem. Tento rozdíl může být výhodou, pokud je objem vzorku omezujícím faktorem.

Několik výrobců izolačních souprav RNA má na internetu k dispozici srovnávací grafy. Tyto grafy mohou být použity k vidět rozdíly mezi různými soupravami, které produkují. Rozdíly mohou zahrnovat specializované typy aplikací, chemikálie a potřebné objemy vzorku.