Quels sont les différents types de kits d'isolation d'ARN?
La plupart des kits d'isolation à base d'acide ribonucléique (ARN) peuvent isoler un ARN de haute qualité provenant d'un large éventail de tissus et de types d'organismes, notamment de plantes, d'animaux et de virus. Les ARN mitochondriaux et ribosomiques - ARNm et ARNr, respectivement - peuvent nécessiter des kits d’isolation d’ARN spécifiques, spécifiques aux petits brins d’ARN. La quantité d'échantillons que chaque kit peut traiter et le temps nécessaire au traitement complet d'un échantillon peuvent également varier selon les kits d'isolement.
Les types les plus courants de kits d'isolation d'ARN peuvent être utilisés pour une grande variété d'applications, quelle que soit l'origine de l'ARN. Les cellules et les tissus de mammifères sont parmi les sources les plus utilisées pour l'isolement et la purification de l'ARN. Les cellules végétales et les virus sont également utilisés dans des expériences de biologie moléculaire nécessitant l'utilisation d'un kit d'isolement d'ARN.
Une fois que l'échantillon de tissu ou de sang est prélevé, il doit être préparé pour l'isolement de l'ARN au cours d'un processus critique appelé dégradation, séparation ou perturbation cellulaire. Si le matériel cellulaire n'est pas terminé, le processus d'isolation d'ARN produira moins d'ARN. Les meilleurs kits d'isolation d'ARN comprennent des matériaux et des fournitures pour la dégradation cellulaire avant l'isolation et la purification de l'ARN après l'isolation.
Dans les cas particuliers où une expérience nécessite un ARNm ou un ARNr, des kits d'isolation d'ARN spécialisés sont disponibles pour les brins d'ARN particulièrement petits. Le matériel et les fournitures inclus dans un tel kit peuvent être différents en termes de quantité et de taille. Ces kits d’isolement d’ARN sont moins courants que les kits d’ARN polyvalents et peuvent présenter une différence de coût substantielle.
De nombreux kits d'isolement d'ARN courants sont conçus pour être utilisés avec tous les types de tissus et de cellules et peuvent compléter une réaction en environ 20 minutes. Le temps nécessaire à une dégradation cellulaire complète peut varier selon l'endroit où les cellules ont été collectées dans l'organisme. Au-delà de l’étape de la dégradation cellulaire, le processus d’isolement de l’ARN et sa purification ultérieure sont relativement standard en termes de procédure et de temps.
Une autre caractéristique qui peut être spécifique à certains kits est la quantité d’échantillon requise pour traiter la réaction. Certains kits d’isolement peuvent nécessiter un volume d’échantillonnage relativement important, mais d’autres peuvent bien fonctionner avec un volume inférieur. Cette différence peut être un avantage si le volume de l'échantillon est un facteur limitant.
Plusieurs fabricants de kits d’isolation d’ARN disposent de tableaux comparatifs sur Internet. Ces graphiques peuvent être utilisés pour voir les différences entre les différents kits qu’ils produisent. Les différences peuvent inclure des types d'applications spécialisées, des produits chimiques et les volumes d'échantillons requis.